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zhang_jaj木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
lammps文件原子屬性顯示問(wèn)題-atomeye, OVITO, Pymol 已有1人參與
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因?yàn)橛?jì)算完后獲取了atom幾種不同的屬性值，比如CNA，現(xiàn)在想按照這幾種值來(lái)顯示顏色。有幾個(gè)問(wèn)題： 1. 用atomeye顯示這種屬性顏色是最方便的，但是問(wèn)題是顏色方案不太好，總是調(diào)不到區(qū)分度較大的顏色。有個(gè)比較好的顯示rainbow方案，不過(guò)在一些期刊上又嫌這個(gè)顏色online版和print版的灰度值一樣（藍(lán)和紅）沒(méi)法區(qū)分。 2. 用OVITO顯示的顏色相對(duì)來(lái)說(shuō)很好看，不過(guò)顏色方案貌似更少。只有jet，hot， grayscale和rainbow。而且我找了好久沒(méi)法調(diào)整顏色，不知道誰(shuí)有比較好的方法嗎？并且這個(gè)軟件沒(méi)法讓atom周期平移來(lái)顯示想要的某個(gè)面的圖像嗎？只能通過(guò)切面嗎？還有這里能隱藏某些沒(méi)選擇了atom嗎，沒(méi)有找到。 3. 對(duì)于Pymol（顏色也很漂亮），如果想顯示不同的顏色，是只能按照之前的屬性編程把a(bǔ)tom變成不同的元素名字并轉(zhuǎn)為pdb文件嗎？ |
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zhang_jaj
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5樓2014-07-24 19:59:36
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