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summit061800新蟲 (初入文壇)
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[求助]
鏈霉菌鑒定 已有3人參與
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用特異性引物pcr，鑒定鏈霉菌種類，菌落外觀形態(tài)和菌絲形態(tài)完全不同的幾個菌株，竟都可以擴增出特異性條帶，這是為什么呀？ps：引物引自別人的文獻，不是自己設(shè)計的 [ 發(fā)自手機版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
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4樓2014-07-27 22:31:42
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【答案】應(yīng)助回帖
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這樣做是不可靠的，首先簡單通過形態(tài)并不能準確判斷種屬，你如果先假定它是某個種，然后再用相關(guān)文獻里報道的特異性引物去pcr來確定種屬，這個思路本身就是不嚴謹?shù)模彩鞘卤豆Π氲�，相同種的不同株基因組dna都有差異，何況這些菌都是你篩選出來的，另外你這樣做很容易受到別人實驗結(jié)果的影響，他的特異性片段確定只在這個種里才有嗎？不能確定的話這個方法就不能用的，鑒定真核微生物一般是測ITS序列，可以先用通用引物，這段序列比較保守，同種差異不大，序列測出后在ncbi里面blast，會有相似度由高到低的結(jié)果，想更確定判斷可以做進化樹 [ 發(fā)自手機版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
6樓2014-07-27 22:59:13
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