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summit061800新蟲(chóng) (初入文壇)
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鏈霉菌鑒定 已有3人參與
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用特異性引物pcr，鑒定鏈霉菌種類(lèi)，菌落外觀形態(tài)和菌絲形態(tài)完全不同的幾個(gè)菌株，竟都可以擴(kuò)增出特異性條帶，這是為什么呀？ps：引物引自別人的文獻(xiàn)，不是自己設(shè)計(jì)的 [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
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2樓2014-07-27 21:40:57
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3樓2014-07-27 22:12:27
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4樓2014-07-27 22:31:42
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5樓2014-07-27 22:45:13
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【答案】應(yīng)助回帖
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這樣做是不可靠的，首先簡(jiǎn)單通過(guò)形態(tài)并不能準(zhǔn)確判斷種屬，你如果先假定它是某個(gè)種，然后再用相關(guān)文獻(xiàn)里報(bào)道的特異性引物去pcr來(lái)確定種屬，這個(gè)思路本身就是不嚴(yán)謹(jǐn)?shù)模彩鞘卤豆Π氲�，相同種的不同株基因組dna都有差異，何況這些菌都是你篩選出來(lái)的，另外你這樣做很容易受到別人實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響，他的特異性片段確定只在這個(gè)種里才有嗎？不能確定的話這個(gè)方法就不能用的，鑒定真核微生物一般是測(cè)ITS序列，可以先用通用引物，這段序列比較保守，同種差異不大，序列測(cè)出后在ncbi里面blast，會(huì)有相似度由高到低的結(jié)果，想更確定判斷可以做進(jìn)化樹(shù) [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
6樓2014-07-27 22:59:13
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10樓2014-07-29 20:35:30
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