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tsihu捐助貴賓 (小有名氣)
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[交流]
[求助] 關(guān)于分子能量的計(jì)算與處理
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本人研究的分子有兩種可能構(gòu)象,現(xiàn)在想計(jì)算分別的分子能量進(jìn)行比較以確定哪一種更為穩(wěn)定.感到困擾的是這個(gè)分子能量是指構(gòu)型優(yōu)化后的out文件里的SCF Done后的能量還是單點(diǎn)能計(jì)算后得到的能量. 還有就是怎么用零點(diǎn)能(zero point energy)進(jìn)行修正. 望知曉這方面的先行者不吝指教.謝謝. |
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 仿真建模與計(jì)算 |
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cuihang
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7樓2008-04-08 11:18:55
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★ ★ ★
lei0736(金幣+3,VIP+0):謝謝
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既然有兩種可能構(gòu)型，一般都是以這兩種構(gòu)型為初始構(gòu)型，分別進(jìn)行構(gòu)型優(yōu)化，優(yōu)化后，看最終的構(gòu)型相同還是不相同，如果不相同，那么再比較優(yōu)化后OUT文件中的能量。 如果要進(jìn)行零點(diǎn)能修正，則在構(gòu)型優(yōu)化后進(jìn)行頻率計(jì)算freq，那么OUT文件中就直接有零點(diǎn)能以及修正后能量的結(jié)果。 建議在計(jì)算時(shí)，仔細(xì)看看Gaussian03手冊(cè)中關(guān)于OPT以及Freq頻率計(jì)算的相關(guān)內(nèi)容。里面涉及你需要的東西。 |
2樓2008-04-07 16:46:06
SHY31
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小木蟲(chóng)研究生院西南地區(qū)區(qū)長(zhǎng)
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3樓2008-04-07 17:50:18
★ ★ ★
lei0736(金幣+3,VIP+0):又見(jiàn)高手 呵呵
lei0736(金幣+3,VIP+0):又見(jiàn)高手 呵呵
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優(yōu)化和單點(diǎn)計(jì)算都能給出能量。優(yōu)化對(duì)基組和方法的依賴性不是很大，一般用較小基組就可以了，但是能量則不同，往往需要加大基組，比如增加極化函數(shù)，彌散函數(shù)。所以LZ的情況，可以直接比較優(yōu)化后的能量（如果可以分清楚的話）也可以在優(yōu)化的基礎(chǔ)上進(jìn)行更大基組的單點(diǎn)計(jì)算已獲得更為準(zhǔn)確的能量值 零點(diǎn)能矯正同樓上 頻率計(jì)算是為了檢測(cè)找到的結(jié)構(gòu)是否為局域極小點(diǎn)，結(jié)構(gòu)是否穩(wěn)定 HOMO-LUMO gap 一般只表示分子的化學(xué)穩(wěn)定性，熱力學(xué)穩(wěn)定性可以計(jì)算其鍵能 |
4樓2008-04-07 20:08:30
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