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研究肉中微生物多樣性,肉DNA對(duì)后面高通量測(cè)序(細(xì)菌16S、真菌ITS1)有什么影響? 已有1人參與
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并沒有對(duì)肉中微生物進(jìn)行分離培養(yǎng),是直接提取肉中微生物的DNA,所提取的DNA一定含有肉的DNA。 測(cè)序公司說,這會(huì)使測(cè)序時(shí)很浪費(fèi),盡可能不要把肉的DNA提取出來(lái)。 難道就沒有真菌特異性引物嗎? 初學(xué)者,而且還是非分子生物學(xué)專業(yè)的,勿拍。 求指導(dǎo)。 |
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我最近看到一篇文獻(xiàn),挺好的,PCR-SSCP-based reconstruction of the original fungal flora of heat-processed meat products ————Samart Dorn-In a,⁎, Christina S. Hölzel a, Tobias Janke a, Karin Schwaiger,2013 International Journal of Food Microbiology 附件上傳不了 共勉 之前我一直問測(cè)序公司有沒有只擴(kuò)增真菌ITS1的特異性引物,她一直說沒有,她說盡可能不要把肉的DNA提取出來(lái),盡可能去除。思維就定在了怎么盡可能不把肉DNA提取出來(lái),就沒有想到換個(gè)思維,為什么就沒有特異性引物呢? |
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