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[求助]
知道亞種如何找現(xiàn)成的16S rRNA鑒定引物？ 已有2人參與
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各位前輩 我想用PCR的方法鑒定某一特定的微生物亞型 有什么數(shù)據(jù)庫(kù)能找到現(xiàn)成的引物嗎？ 或者通用引物要怎么找？ 是不同的可變區(qū)引物不同？ 如果我之前用V4-V5可變區(qū)的通用引物 并不能區(qū)分這幾個(gè)微生物 換可變區(qū)的引物有用嗎？ 謝謝 |
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2樓2014-08-05 08:45:03
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4樓2014-08-05 09:55:11
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7樓2014-08-06 11:57:58
8樓2014-08-06 16:39:47
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那請(qǐng)問(wèn)前輩 我是要找到這個(gè)四個(gè)微生物的特異看家基因 然后再NCBI里面進(jìn)行BLAST 看看其在數(shù)據(jù)庫(kù)里面的特異性嗎？ 特異的看家基因要如何找呢？ 我現(xiàn)在的問(wèn)題就是單獨(dú)分離耗時(shí)耗力 并且培養(yǎng)的局限性不一定能培養(yǎng)出來(lái) 我前期做了測(cè)序的結(jié)果是每個(gè)樣本里面都有 但是我自己培養(yǎng)的時(shí)候卻是有的可以培養(yǎng)出來(lái)有的培養(yǎng)不出來(lái) 所以我想找個(gè)分子手段 提取總的DNA進(jìn)行檢測(cè) 要如何根據(jù)管家基因進(jìn)行檢測(cè)呢 我一直把管家基因理解為內(nèi)參 如beta-actin 請(qǐng)指教 |
10樓2014-08-07 10:07:17
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