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萬木有靈

金蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 蛋白質(zhì)組學(xué)

[求助] 相對單位與絕對單位的定義

我們在circos.conf文件中定義有chromosomes_units = 1000000，它才會以Mb為單位顯示。在circos的繪圖單位中，有一個u單位，這個u就是指的chromosomes_units了。如果你將chromosomes_units設(shè)置成10M,那么上面的語句就需要改成hs1:0-10…這樣子。
   我們前面已經(jīng)了解到了一些，在ideogram.conf文件中<spacing>…</spacing>就是用于設(shè)置間隔的,也了解到什么是u單位。在circos中，除了u單位，還有一個r單位。r是
relative的首字母，它是指相對于全圖的大小。比如本文中使用的deault = 0.005r就是使用的r單位。我們可以將u視作絕對單位，把r視作相對單位。
                                                                                                                                                                                                                  文獻(xiàn)來自于《circos系列教程合集》
   我在網(wǎng)上搜過，但是還是不太明白。我個人觀點是把它理解成了相對值和定值。個人理解的估計有偏差。希望各位大神能用自己的語言幫我解釋下。

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1樓 2014-08-10 11:08:15

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