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allen.tsui金蟲 (正式寫手)
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《讀懂天然產(chǎn)物系列》-5-”面朝大海,不只花開“-讀一篇”龍“形天然產(chǎn)物文獻(xiàn)
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您的選擇:《讀懂天然產(chǎn)物系列》誠邀您撰寫屬于您自己的文獻(xiàn)評(píng)論!撰寫鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7732034&fpage=1 引言 這一切還要從1998年的夏天說起,具體到哪一天就不知道了,只知道新西蘭惠靈頓蔚藍(lán)色的海灣上泛起了一片紅。 如果是在欣賞風(fēng)景來著,藍(lán)色夾雜些紅色呈現(xiàn)在海水中看起來還是很漂亮的,但是科學(xué)告訴我們這是一種赤潮現(xiàn)象,也是新西蘭惠靈頓海灣周圍生物不幸的開始。 剛開始,生長在赤潮海域中的魚、牡蠣等生物相繼出現(xiàn)了死亡狀況,隨后生活在這片海域附近的一些人也患上了不同程度的干咳、頭痛等疾病。這些狀況的出現(xiàn)不得不引起科學(xué)家的注意,經(jīng)過調(diào)查,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)造成此次災(zāi)難的元兇是一種未知海藻,隨后被命名為Karenia brevisulcata 。與此同時(shí),本文要介紹的主角(附件1, Yuka Hamamoto, Kazuo Tachibana, Patrick T. Holland, et al. Brevisulcenal-F: A Polycyclic Ether Toxin Associated with Massive Fish-kills in New Zealand. J. Am. Chem. Soc. 2012.)漸漸浮出水面。 正文 A 聯(lián)想 "科研工作者要具有一定的聯(lián)想能力,而這種能力往往是建立在對(duì)大量的文獻(xiàn)調(diào)研與分析上。" 在查閱Karenia(凱倫藻屬)其他種時(shí),研究者發(fā)現(xiàn)同屬的Karenia brevis(短凱倫藻)和Karenia mikimotoi(米氏凱倫藻)能分別產(chǎn)生brevetoxins和gymnocins毒素,那么 Karenia brevisulcata那么Karenia brevisulcata是否也產(chǎn)生毒素呢?這只有通過對(duì)其進(jìn)行初步的毒性試驗(yàn)來驗(yàn)證了。相關(guān)研究證實(shí)了事先的推斷,詳見附件3。 B 效率 "當(dāng)有了目標(biāo)之后,如何才能盡快達(dá)成就涉及到方法論的范疇了。" 細(xì)胞毒性追蹤指導(dǎo)分離,本是老生常談的話題了,但在本篇文獻(xiàn)中被用到了極致。不斷的通過毒性追蹤,直至分離出目標(biāo)化合物。這些是值得深思的,比如有時(shí)候方法都為人所知,只是不同的人在運(yùn)用時(shí),其產(chǎn)生的作用是不同的。 C 堅(jiān)持 "化合物的鑒定工作是枯燥的,這中間要有對(duì)各種分析技術(shù)的靈活選擇,也要有做好長期解析的心態(tài),然后堅(jiān)持至勝利。" 在對(duì)Brevisulcenal-F的解析過程中,科研工作者用上了“十八般武藝”并花費(fèi)了1年多的時(shí)間,最終將Brevisulcenal-F結(jié)構(gòu)鑒定為一個(gè)類似于龍形的多環(huán)醚。結(jié)構(gòu)如下圖: D 嚴(yán)謹(jǐn) "是人難免就會(huì)有紕漏,科研人員也是人。如何避免紕漏的產(chǎn)生,這就涉及到工作中是否嚴(yán)謹(jǐn)了。" 從解出出的Brevisulcenal-F結(jié)構(gòu)看,其碳、氫、氧數(shù)量巨大,各環(huán)之間連接有序,最終形成了多環(huán)醚。但是Brevisulcenal-F的結(jié)構(gòu)信息表現(xiàn)在核磁圖譜上就很復(fù)雜了,所以在解析過程中可能會(huì)出現(xiàn)個(gè)別紕漏,于是采用另外一種方法去驗(yàn)證就不免提上了日程;谇叭藢(duì)類似結(jié)構(gòu)的解析經(jīng)驗(yàn),本篇文獻(xiàn)采用的是先制備出Brevisulcenal-F的衍生物,然后采用MS/MS方法,最終通過對(duì)各個(gè)碎片離子峰的確認(rèn),證實(shí)了先前對(duì)Brevisulcenal-F的解析是正確的。 E 亮點(diǎn) 1. 文章的選題很有意義。本篇文獻(xiàn)就新西蘭惠靈頓發(fā)生的赤潮后引起的危害為切入點(diǎn)。 2. Brevisulcenal-F出自一個(gè)新發(fā)現(xiàn)的物種(Karenia brevisulcata)中,且結(jié)構(gòu)很新穎。Brevisulcenal-F出自一個(gè)新被發(fā)現(xiàn)的物種為文章增色了不少。多環(huán)醚類化合物雖然從海洋生物出分離出過,但是Brevisulcenal-F的結(jié)構(gòu)還是有區(qū)別于以前發(fā)現(xiàn)的多環(huán)醚的,用文獻(xiàn)中的話就是“NMR and MS/MS analyses revealed the complete structure for KBT-F, which is characterized by a ladder-frame polyether scaffold, a 2-methylbut-2-enal terminus, and an unusual substituted dihydrofuran at the other terminus”。 3. Brevisulcenal-F含量在Karenia brevisulcata中含量很多,且毒性很強(qiáng)。文章中說“we report the structure of brevisulcenal-F which is one of the most abundant toxins in K. brevisulcata”, “The mouse lethality of KBT-F was estimated to be 0.032 mg/kg”。另外,這個(gè)鏈接(http://www.u-tokyo.ac.jp/en/utokyo-research/research-news/brevisulcenal-f/)給出了Brevisulcenal-F毒性的具體參數(shù),是氰化鉀的300倍。以上不就暗示了Brevisulcenal-F是造成新西蘭惠靈頓附近海域各種生物危害的罪魁禍?zhǔn)琢藛?My god!!!這解決了多大問題啊,雖然僅僅只是暗示,是推測。話說回來,無疑給文章增分很多! 4. Brevisulcenal-F結(jié)構(gòu)的確認(rèn)是經(jīng)過很嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)得到的。首先,經(jīng)過各種常規(guī)的波譜學(xué)實(shí)驗(yàn)得到Brevisulcenal-F的結(jié)構(gòu),最后又經(jīng)過MS/MS實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步確認(rèn)。我想,這么嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)無疑是打動(dòng)JACS編輯的原因之一。 番外 1. a 通訊作者介紹:Masayuki Satake (佐竹真幸),東京大學(xué)理科化學(xué)部副教授,主要從事海洋天然產(chǎn)物研究。摘自:http://www.s.utokyo.ac.jp/en/people/index.php/SATAKE. b 本篇文獻(xiàn)的作者以及通訊作者的合影。摘從:http://d.hatena.ne.jp/TodaiGCOE/20120323. 中間為作者Yuka Hamamoto(浜本優(yōu)香);右邊為通訊作者M(jìn)asayuki Satake (佐竹真幸) c 東京大學(xué)對(duì)Brevisulcenal-F相關(guān)工作的介紹:http://www.u-tokyo.ac.jp/en/utokyo-research/research-news/brevisulcenal-f/. 2. 新西蘭研究海洋生物的Cawthron Institute: http://www.cawthron.org.nz/analytical-services/. 3. Brevisulcenal-F類似結(jié)構(gòu)的全合成。全合成大牛KCN對(duì)Maitotoxin(刺魚毒素)的全合成工作。 Maitotoxin 4. 海洋天然產(chǎn)物的相關(guān)綜述。NPR上幾乎每年一篇對(duì)海洋天然產(chǎn)物的綜述,現(xiàn)上傳近三年的文章。詳見附件4。 以上只是我讀完文獻(xiàn)的一些感受(僅為拋磚引玉),由于個(gè)人水平有限,還望各位海涵,謝謝! 淘帖鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/taotie.php?action=view&ttid=55868.歡迎大家來訂閱 上一帖鏈接:《讀懂天然產(chǎn)物系列》-4-“變型”金剛:絕跡重生 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7676565&fpage=2 《讀懂天然產(chǎn)物系列》開帖篇地址:http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7538755&fpage=1[ Last edited by allen.tsui on 2014-8-11 at 21:46 ] |
木蟲 (正式寫手)
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