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culferry鐵桿木蟲(chóng) (小有名氣)
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熒光定量PCR檢測(cè)植物mRNA表達(dá)情況,現(xiàn)在僅知道蛋白名稱,不知道該如何下手。 已有1人參與
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熒光定量PCR檢測(cè)植物mRNA表達(dá)情況,現(xiàn)在僅知道蛋白名稱,不知道如何下手,求高手指點(diǎn)! 我要檢測(cè)表達(dá)的蛋白是: 1、鄰氨基苯甲酸合成酶(Anthranilate Synthase,AS); 2、色氨酸合成酶(Tryptophan synthase,TSB); 3、異胡豆苷-β-D-葡萄糖苷酶(Strictosidine-β-D-glucosidase,SGD); 4、細(xì)胞色素P450氧化還原酶(Cytochrome P450 Reductase, CPR)。 能否幫忙設(shè)計(jì)一下熒光定量PCR引物,或者指點(diǎn)一下怎么設(shè)計(jì),謝謝!我是新手請(qǐng)多指教! |
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這個(gè)問(wèn)題我來(lái)解答。 1. NCBI搜這些基因(一般蛋白和基因名字是一樣的),這時(shí)候分為兩種情況: (1)在你研究的物種中已有報(bào)道該序列,那么簡(jiǎn)單了,直接設(shè)計(jì)引物pcr200bp左右,ok就直接上qPCR (2)沒(méi)有報(bào)道你物種的該基因,那么又有兩種情況 (a)已測(cè)轉(zhuǎn)錄組或基因組,從注釋后的庫(kù)里找出你的基因或者部分,設(shè)計(jì)引物pcr方法同上 (b)什么都沒(méi)有,那就從別的物種中找這個(gè)基因,肯定有很多,找和你物種接近的,比如都是菊科的植物,然后blast,找到保守區(qū)域,設(shè)計(jì)引物PCR方法同上 明白了嗎? 具體那種情況告訴我 ,我在幫你分析下! |

鐵桿木蟲(chóng) (小有名氣)
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
鐵桿木蟲(chóng) (小有名氣)
鐵桿木蟲(chóng) (小有名氣)
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