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如何研究抗生素合成基因簇中的調(diào)控基因?qū)@個抗生素的調(diào)控作用 已有3人參與
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想研究放線菌中NRPS抗生素合成基因簇中一個未知功能的調(diào)控基因?qū)@個抗生素本身的是否有調(diào)控作用。在敲除和過表達后如果會影響抗生素的合成后。如何研究其具體機制。有人建議研究調(diào)控基因與啟動子的互作,但是本基因簇有64ORF,是否要各個研究。如果確定了其結(jié)合的啟動子區(qū)域,如何再進一步研究其具體機制? 如果換作您,您有怎樣的構(gòu)思?謝謝 |

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看來你已經(jīng)做了基因敲除和過表達了,只是不知道你基因敲除和過表達的表現(xiàn)型是什么樣子的結(jié)果,這直接關系到下一步工作。 其實最簡單的就是將敲除的和過表達的菌株針對于64個ORF做一個實時定量RT-PCR,看看其對不同基因表達的影響,找出明顯影響的基因再做調(diào)節(jié)蛋白與DNA的互作應該就初步會得出結(jié)果,再做受影響基因蛋白表達產(chǎn)物的變化。最后根據(jù)受影響蛋白的結(jié)構(gòu)分析其功能,對其功能進行驗證。 |
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