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ggyy0911

鐵蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 4 (幼兒園)
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紅花: 8
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在線: 148.2小時(shí)
蟲號(hào): 1888956
注冊(cè): 2012-07-11
性別: MM
專業(yè): 臨床獸醫(yī)學(xué)

[求助] 新手求助！怎么給多亞基且不相同的酶建模？？

想對(duì)一個(gè)已經(jīng)截短的酶建模，4個(gè)亞基，第5個(gè)截了。
  SWISS-Model同源建模的時(shí)候，搜索出的模板有五個(gè)亞基的全酶，同源性很低，不到30%。
  然后就是同源性很高的一個(gè)酶的單獨(dú)亞基，五個(gè)片段，我不懂為什么沒有這個(gè)酶的全酶模板，只有單獨(dú)亞基的。
  如果用全酶建模，第一是同源性低；
  第二是建模后我用pymol看，標(biāo)記肽鏈只有一條，用swiss難道只能建同源多聚體的蛋白？
  第三是如果用全酶建模，建出來的是5個(gè)亞基的話，我的酶截短豈不是沒有意義了，再用這個(gè)模型去做分子對(duì)接不就沒意義了。

  再者，搜索出的每個(gè)單獨(dú)模板同源性都很高，那我能用這些單獨(dú)的亞基去建一個(gè)4亞基的蛋白模型嗎？
  求助高手�。。。�

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1樓 2014-09-01 21:30:57

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