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卡開(kāi)發(fā)發(fā)專家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
Ab Initio Amateur
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[求助]
mpiifort+mkl編譯ELK運(yùn)行問(wèn)題求助 已有1人參與
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本人編譯ELK,采用的是mpiifort(v11)+mkl(v10.2),編譯過(guò)程沒(méi)什么問(wèn)題。問(wèn)題在于運(yùn)行過(guò)程,我嘗試運(yùn)行了test-001下面例子,計(jì)算得到的能量似乎和程序得到的能量有很大差異,如果不采用mkl而采用內(nèi)置的lib就沒(méi)有這個(gè)問(wèn)題,但核心利用效率很低(程序如不考慮mkl_thread會(huì)按照k并行,如果采用mkl_thread則可以提升效率)。 另外,vasp采用mkl有時(shí)也會(huì)出現(xiàn)“正能值”的問(wèn)題。這兩個(gè)問(wèn)題是否同一原因?qū)е?(測(cè)試下來(lái)SIESTA并沒(méi)有這樣的問(wèn)題)。 對(duì)于這些問(wèn)題有什么解決方案?產(chǎn)生這些問(wèn)題的原因是什么?從這個(gè)問(wèn)題看,如果是自己寫(xiě)程序該注意些什么? |
軟件交流 |

專家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
Ab Initio Amateur
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專家經(jīng)驗(yàn): +224 |
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問(wèn)題已經(jīng)解決, zfftifc_fftw.f90用mkl編譯會(huì)出問(wèn)題,不采用mkl即可。 非k點(diǎn)并行fft_lib用-lfftw3和-lfftw3_threads即可,編譯前做如下設(shè)置(參照官網(wǎng)以12核心為例): export OMP_NUM_THREADS=4 export OMP_NESTED=true export OMP_DYNAMIC=false export MKL_NUM_THREADS=8 export MKL_DYNAMIC=true 這樣即便gamma點(diǎn)也可以并行。 |

鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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不同版本的MKL的參數(shù)會(huì)發(fā)生一定變化,程序并未修改,這導(dǎo)致有的時(shí)候有隱蔽的錯(cuò)誤發(fā)生——或者對(duì)于某些體系有錯(cuò)誤發(fā)生(內(nèi)存用量達(dá)到一定程度的時(shí)候)。 如果算出來(lái)和樣例不對(duì)就肯定有問(wèn)題,可以嘗試換默認(rèn)LAPACK/BLAS, ATLAS, GotoBLAS等等看看結(jié)果有無(wú)變化。 |
專家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
Ab Initio Amateur
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專家經(jīng)驗(yàn): +224 |

木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
star watcher
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