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aileen小寧鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
分子對接問題！請教各位大神幾個關(guān)于分子對接的問題 已有1人參與
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小樓因?yàn)橐霎厴I(yè)論文剛接觸到分子對接軟件，做的是小分子配體和蛋白質(zhì)的對接，想問幾個入門問題，問的淺顯還望大神勿噴。 1 從PDB中下載的蛋白復(fù)合晶體可以分離嗎（看其他相似論文有這種說法），但我試過在ADS里面打開好像只有蛋白的結(jié)構(gòu)，藥物分子的看不到，求解。 2 配體分子都是自己根據(jù)構(gòu)效關(guān)系設(shè)計出來的嗎？還是說能設(shè)置參數(shù)之類的通過autodock 軟件設(shè)計出來？看到有參考說到生物電子等排替換不知道怎么回事。 3 聽說配體分子是用chemdraw畫出來的，再用PMOL優(yōu)化.....還有其他方便的辦法木有，pmol也不會用啊啊啊... 4 grid box參數(shù)和對接運(yùn)行參數(shù)設(shè)置如何確定 第一次在木蟲里發(fā)帖，新手金幣也不多，問題可能很水....見諒見諒 希望有大神出來幫幫我，跪謝啊  |
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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2樓2014-09-17 00:27:39
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