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敏sunflower金蟲 (小有名氣)
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[交流]
速度自相關(guān)函數(shù) 已有4人參與
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對于分子模擬方法計算自擴散系數(shù)，有帖子提到可以用速度自相關(guān)函數(shù)來計算。而且，帖子中還有人提到，由于通過MSD-t曲線得到擴散系數(shù)的方法不是適用于所有的體系，相比之下，通過速度自相關(guān)函數(shù)求取更好！ 我有三方面有些不解，還請大家?guī)兔χ更c一二！ 1. 速度自相關(guān)函數(shù)計算擴散系數(shù)的方法適用于什么樣的體系那? 所有的擴散都適合嗎？ 2. MSD-t曲線球擴散系數(shù)的方法適用于什么樣的體系吶？ 3.如果想通過速度自相關(guān)函數(shù)計算擴散系數(shù)的話，有沒有相關(guān)的教程吶? 我看到有用LAMMPS軟件做的，MS軟件可不可以那？ |
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對于均一體系自擴散系數(shù)的計算，MSD與速度自相關(guān)函數(shù)兩種方法是等價的。只是速度自相關(guān)函數(shù)技術(shù)上操作起來有時有點困難，如果采樣不夠長的話函數(shù)噪音很大，積分起來誤差比較大。 對于大多數(shù)體系，自擴散系數(shù)足夠表征擴散了。有些情況下，有人會研究互擴散系數(shù)，比如這個帖子 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7230279&fpage=1&target=blank 這里會用到速度關(guān)聯(lián)函數(shù)的交叉形式。 對于非均一體系(anisotropic)體系，這是的自擴散系數(shù)不再是個常數(shù)，是個張量(diffusivity tensor），雖然這個張量在某些維度上的值仍然可以用MSD和速度自相關(guān)函數(shù)的分量來計算，但總體來講這個情況比較復雜，需要特殊處理。 LAMMPS可以做VACF，material studio，我在網(wǎng)上搜了一下，貌似Forcite Plus可以做。你可以驗證一下VACF和MSD得到的自擴散系數(shù)是否大致符合。 |
2樓2014-09-20 11:56:56
fwforest
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3樓2015-02-05 12:51:53
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abinitio: 金幣+2, 感謝精彩應助！ 2015-02-06 08:59:00
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難道你不看manual么？照著manual的例子先做一遍再說。 http://lammps.sandia.gov/doc/compute_vacf.html |
4樓2015-02-05 13:37:55
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