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fengshiquan鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
MS建模問(wèn)題 已有1人參與
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| 已經(jīng)用gaussview建立一個(gè)離子液體對(duì)，并導(dǎo)入到MS中了，請(qǐng)問(wèn)如何在MS中建立盒子、添加一定數(shù)目的離子液體，請(qǐng)各位蟲友指教，謝謝 |
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fengshiquan: 金幣+20, ★★★很有幫助, 謝謝你的回復(fù)，我去試一下，有問(wèn)題再請(qǐng)教你 2014-09-22 21:56:19
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你在GaussianView里不必建離子對(duì)啊，就建單個(gè)離子，因?yàn)殡x子在溶液環(huán)境下是分散的，然后將離子分別倒入到MS，賦予它們力場(chǎng)和電荷，然后在MS里有一個(gè)Amorphous Cell模塊，選calculation，出來(lái)一個(gè)選擇框，選中你要加入的離子和在其右邊水設(shè)置好粒子個(gè)數(shù)，設(shè)置好密度，還有其他的一些設(shè)置，如力場(chǎng)、范得華力和靜電力。這樣就可以了。 另，若你不知道準(zhǔn)確密度，可先設(shè)一個(gè)大概密度，然后NPT跑動(dòng)力學(xué)，從輸出文件里就可以知道準(zhǔn)確密度了 |
2樓2014-09-22 09:06:41
fengshiquan
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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3樓2014-09-22 22:44:50
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4樓2014-09-23 09:41:02
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