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xuerongtao銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
系統(tǒng)樹如何分析
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大家好： 測(cè)序是送CCTCC測(cè)得，16S rRNA序列。 序列BLAST后搜到幾十株同源性在92%以上的菌株，選取97%以上的10株左右，最高的99%同源性然后借助MEGA5.0，Neighbor-Joining Tree分析法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹并通過Bootstrap method 1000，在最終獲得發(fā)育樹，見下圖。但是不知道怎么分析，因?yàn)閷懳恼虏豢赡芫桶褬鋽[上完了，我不會(huì)專業(yè)的分析。求教專家的蟲友幫忙分析一下  |
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4樓2014-10-02 13:36:02
lcat
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分析分兩部分進(jìn)行，首先說一下 你的序列跟xxx xxx的同源性分別為多少%，跟FZB42同源性為多少%，這是blast的結(jié)果，說明從中可以看出與FZB42是具有最高的序列同源性的。 其次，根據(jù)后續(xù)的系統(tǒng)進(jìn)化分析 進(jìn)一步驗(yàn)證了該結(jié)論，即你的序列與FZB42是在同一個(gè)枝上，因此可以推斷你的這個(gè)菌跟FZB42的種屬關(guān)系比較接近 |
7樓2014-10-03 19:07:06
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9樓2014-10-04 10:25:22
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