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zengsihai木蟲 (小有名氣)
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測(cè)序結(jié)果不好的序列能夠做系統(tǒng)發(fā)育樹嗎？ 已有2人參與
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各位蟲友： 小弟對(duì)一株真菌PCR其ITS區(qū)，送測(cè)序后效果不好，要求是雙向測(cè)序并且拼接，但是生工告知無法拼接，僅有兩條兩個(gè)方向的測(cè)序結(jié)果。但是，BLASTN比對(duì)有找到相似性，與Fusarium solani相似達(dá)99%，可以知道該菌應(yīng)該是茄鐮刀菌了，但是我嘗試在NCBI上下載它的一些近似種鐮刀菌，擬做一個(gè)系統(tǒng)發(fā)育樹，以期進(jìn)一步分析它的種屬，好提煉一些觀點(diǎn)，可是用CLUSTAL X和MEGA6.0，發(fā)現(xiàn)待分析序列與下載的已知序列相比，一段一段的，能做出系統(tǒng)發(fā)育樹嗎？ 蟲友，象我這種情況，僅有一個(gè)方向的序列能夠做出系統(tǒng)發(fā)育樹嗎，盼您的指教。 |
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2樓2014-09-10 22:50:37
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3樓2014-09-11 06:19:40
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6樓2014-09-11 10:51:49
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7樓2014-09-11 10:53:32
8樓2014-09-11 13:33:12
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