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livein合肥鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 值都低于70%，求助
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網(wǎng)上說(shuō)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的值應(yīng)該大于70%才有可信度，但是我做的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)基本都小于這個(gè)值，是什么原因呢？是不是同源序列選取的有問(wèn)題��？我是從NCBI上選擇的相似度大多均為100%的序列建的樹(shù)。跪求啊 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
livein合肥: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-06-14 21:13:21
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livein合肥: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-06-14 21:13:21
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不知道樓主構(gòu)建這顆系統(tǒng)樹(shù)意欲何為？貌似都是同一個(gè)菌類(lèi)的物種，而其中有一個(gè)你自己的菌種，所以大膽猜測(cè)是想鑒定菌種。如果出于這個(gè)目的，應(yīng)該多加幾個(gè)其他同屬的物種的序列進(jìn)來(lái)。 分辨率低最大的原因是因?yàn)槟悴捎玫亩际峭粋�(gè)物種的不同基因型/單倍型，本來(lái)互相之間差異就不大，支持率當(dāng)然也就不高了。一般老說(shuō)，分化的越好（或者說(shuō)互相之間進(jìn)化產(chǎn)生的差異越大），支持率就相對(duì)越高。 |
2樓2012-06-14 20:57:42
lys6827
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5樓2012-06-16 12:30:35
6樓2012-09-14 11:00:55
livein合肥
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7樓2012-09-14 11:21:33
8樓2012-09-14 13:16:28
wizardfan
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9樓2012-09-15 07:14:47
zhuojingfei
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10樓2014-11-13 20:38:48
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4樓2012-06-14 21:23:09
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