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livein合肥鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
系統(tǒng)發(fā)育樹 值都低于70%，求助
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網(wǎng)上說系統(tǒng)發(fā)育樹的值應(yīng)該大于70%才有可信度，但是我做的系統(tǒng)發(fā)育樹基本都小于這個值，是什么原因呢？是不是同源序列選取的有問題啊？我是從NCBI上選擇的相似度大多均為100%的序列建的樹。跪求啊 |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
livein合肥: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-06-14 21:13:21
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
livein合肥: 金幣+5, ★★★很有幫助 2012-06-14 21:13:21
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不知道樓主構(gòu)建這顆系統(tǒng)樹意欲何為？貌似都是同一個菌類的物種，而其中有一個你自己的菌種，所以大膽猜測是想鑒定菌種。如果出于這個目的，應(yīng)該多加幾個其他同屬的物種的序列進來。 分辨率低最大的原因是因為你采用的都是同一個物種的不同基因型/單倍型，本來互相之間差異就不大，支持率當(dāng)然也就不高了。一般老說，分化的越好（或者說互相之間進化產(chǎn)生的差異越大），支持率就相對越高。 |
2樓2012-06-14 20:57:42
lys6827
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5樓2012-06-16 12:30:35
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3樓2012-06-14 21:14:36
4樓2012-06-14 21:23:09
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