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[求助]
有沒有計算吸收光譜半峰寬的經(jīng)驗公式 已有1人參與
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| 最近做了一下取代基效應(yīng)對共軛骨架吸收光譜的影響，文獻報道引入X可使吸收紅移，并且光譜展寬。我現(xiàn)在可以做出紅移，展寬高斯做不了好像，只能畫光譜的時候設(shè)定FWHM數(shù)值。我想請教一下，有沒有可以預(yù)測幫峰寬的經(jīng)驗的或者簡單實用的公式？萬分感激�。� |
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lastzealot
新蟲 (著名寫手)
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7樓2014-10-17 21:33:49
ChemiAndy
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
mengsk: 金幣+2, ★★★很有幫助 2014-10-15 08:29:08
gmy1990: 金幣+5 2014-10-16 05:01:47
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gmy1990: 金幣+5 2014-10-16 05:01:47
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本質(zhì)上講，高斯的正則模式分析不能計算紅外峰寬，它得到的永遠是譜線。為什么呢？因為它的計算基于單個構(gòu)型（最優(yōu)構(gòu)象的基態(tài)ground state）， 而實際譜線變寬(broadening/diffusing)，是分子、原子相互作用、運動導(dǎo)致在不同構(gòu)型上吸收的結(jié)果，這從單個構(gòu)型計算是無法得到的。 譜線變寬有多種原因，多普勒效應(yīng)，雜質(zhì)效應(yīng)，量子效應(yīng)（不確定原理）， 壓力效應(yīng)。具體到你的體系，如果引入一個基團，導(dǎo)致骨架某個模式的吸收變寬，很可能是這個基團是吸電子的，弱化了骨架的共軛性能，破壞了骨架的剛性，而柔性的分子有更大的可能在熱作用之下呈現(xiàn)更多的構(gòu)型，從而使譜線變寬。由于峰帶的寬度與溫度、分子偶極變化有關(guān), 而且對環(huán)境以及測量參數(shù)極為敏感，因此不太可能有任何理論能夠預(yù)測這個寬度。（c.f. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21165017） 有一種方法能夠模擬特定溫度下的紅外光譜，就是分子動力學(xué)方法，即系綜平均法。這種方法能夠得到峰帶band。這種方法通過對體系的總偶極的自相關(guān)函數(shù)的傅里葉變換得到吸收光譜，前提是你需要跑一個從頭算分子動力學(xué)，還要計算每一步的總偶極，最后的傅里葉變換也需要特定的code，略微麻煩，感覺你犯不著去趟那趟渾水。 |
2樓2014-10-15 05:52:30
3樓2014-10-15 08:32:26
4樓2014-10-15 08:34:05
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