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求助計算配合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化的輸入文件 已有1人參與
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大家好，近來想計算一下配合物的優(yōu)化，輸入文件如下 %nprocshared=20 %mem=16GB # opt b3lyp/genecp pseudo=read Title Card Required 2 2 C -5.60976080 2.25547701 -0.28960758 C -4.57510480 3.17420201 -0.47840358 C -3.32641480 2.44272401 -0.45794358 N -3.63551580 1.11836001 -0.27150058 C -5.00579780 0.94333901 -0.15680358 C -5.61511080 -0.27630599 0.09089442 C -4.96798380 -1.51201199 0.25309542 N -3.66983644 -1.76522109 0.15374691 C -3.39573380 -3.03788799 0.38435242 C -4.66580980 -3.73288399 0.63692642 C -5.64920680 -2.77530199 0.55206242 C -2.13028839 -3.62739696 0.54302183 C -0.90199980 -3.10685599 0.07763342 N -0.63330980 -1.75997199 -0.18816358 C 0.69377920 -1.58404999 -0.45862458 C 1.31336420 -2.87262199 -0.35653158 C 0.34489220 -3.81523899 -0.01176758 C 1.42266220 -0.40045399 -0.71299458 C 0.86632220 0.89945901 -0.59535358 N -0.53416902 1.03647069 -0.56536932 C -0.79106880 2.40622901 -0.59720258 C 0.47025920 3.25528301 -0.71922458 C 1.54422220 2.24929101 -0.22202558 C -2.04337480 2.99923901 -0.57949058 C -4.69416680 4.64851101 -0.71727758 C -7.05094580 2.47619801 -0.25527558 C -7.69360480 3.61106301 0.07830542 C -7.12985880 -2.93565099 0.72777842 C -4.81427280 -5.19425499 0.96039242 C -4.55921980 -5.52582999 2.45000342 C 0.53383720 -5.28380799 0.21436042 C 2.80864420 -0.61858199 -1.18272558 C 2.73576120 -3.04660899 -0.57889958 N 3.40569920 -1.89276499 -1.01748858 C 4.82951020 -2.03562999 -1.40353658 O 3.46834820 0.26729401 -1.77586158 O 3.35401320 -4.12999699 -0.43763958 C 5.78553420 -1.72563899 -0.24061558 C 7.25952320 -1.88063499 -0.65568458 C 8.24011620 -1.58053399 0.49250142 C 9.70520420 -1.74945999 0.08341242 O 10.63003620 -1.39955299 1.15494442 C 3.00257120 2.63058501 -0.52513758 H 0.40718220 4.12778201 -0.05905558 C 3.39458520 3.99372101 0.07923142 C 3.42115820 4.01093301 1.58934742 O 3.33713920 3.03007501 2.33843842 O 3.57405820 5.29283801 2.06970442 C 3.66078620 5.44693401 3.53019442 C 0.67617420 3.73189401 -2.17539058 H -6.69486380 -0.27079799 0.18880042 H -2.11649893 -4.70306568 0.68477726 H 1.47104220 2.23308501 0.87966642 H -2.03271080 4.08138501 -0.65826458 H -3.86361880 5.02677901 -1.32129558 H -5.62317480 4.88049801 -1.24862358 H -4.70472880 5.22288201 0.21966242 H -7.65894480 1.61443001 -0.52736358 H -7.17780080 4.50657101 0.40544242 H -8.77725480 3.66259301 0.05617442 H -7.49375180 -2.41576999 1.62464342 H -7.68742180 -2.53176599 -0.12740658 H -7.40776480 -3.98910399 0.82913042 H -5.82443580 -5.52807199 0.69141742 H -4.12992180 -5.78805999 0.33881942 H -4.67299680 -6.60041699 2.63514542 H -3.54788480 -5.23158799 2.75263642 H -5.26629380 -4.99013599 3.09297042 H 0.17539820 -5.58382999 1.20711042 H -0.02347180 -5.87496499 -0.52421058 H 1.59055420 -5.54024999 0.13296642 H 4.96375920 -3.06673999 -1.73531058 H 5.00523620 -1.35208599 -2.23543258 H 5.60705720 -0.70051199 0.11013742 H 5.56259120 -2.40217899 0.59455042 H 7.42770320 -2.90479499 -1.02250458 H 7.47266520 -1.20823199 -1.50044458 H 8.09532120 -0.55426999 0.85469142 H 8.02162320 -2.24980699 1.33979042 H 9.88922320 -2.77652299 -0.26928758 H 9.95946520 -1.06630699 -0.73138258 H 10.48458620 -1.99310399 1.91972842 H 3.66962120 1.87258101 -0.11449858 H 3.18936620 2.64520901 -1.59910458 H 4.40510420 4.26100801 -0.26147258 H 2.74680820 4.81015001 -0.25976458 H 3.77196920 6.51742601 3.69055642 H 2.75226220 5.06909901 4.00416142 H 4.52298520 4.89938001 3.91693842 H 0.78051920 2.87601301 -2.85144458 H -0.18265480 4.32509001 -2.50864158 H 1.57253220 4.35300901 -2.27213358 Cu -2.28200657 -0.37030571 0.01386547 C H O 0 6-31G** **** Cu 0 lanl2dz **** Cu 0 lanl2dz 然后計算結(jié)果總是有語法錯誤，想問問大家到底如何弄，以前沒有算過配合物，不知道輸入文件哪兒有錯 General basis read from cards: (5D, 7F) QPErr --- A syntax error was detected in the input line. ' Last state="Top" TCursr= 927 LCursr= 0 Error reading general basis specification. Error termination via Lnk1e in /home/wzq/Gaussian/g09/l301.exe 我計算的是二價銅與脫鎂葉綠素成配體后結(jié)構(gòu)的優(yōu)化，希望大家不吝賜教，我的輸入文件哪兒有問題？該怎么修改 |
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自定義基組以及贗勢使用方法不正確 首先，體系中有氮原子，但沒有給出相應(yīng)基組 C H O 0 應(yīng)該改為 C H O N 0 其次，基組定義結(jié)束后有一個空行，然后才是贗勢部分 所以輸入文件末尾應(yīng)該是 C H O N 0 6-31G** **** Cu 0 lanl2dz **** Cu 0 lanl2dz |
2樓2014-10-23 07:48:26
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