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[求助]
VMD如何讓跨越周期的鍵不顯示 已有1人參與
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大家好！VMD里面，當(dāng)一個(gè)分子到盒子邊界處并跨越了盒子的邊界，若果分子內(nèi)如果所有鍵都顯示的話，跨越邊界的鍵就會(huì)把整個(gè)圖像弄亂，如下面的圖所示， ![\"VMD如何讓跨越周期的鍵不顯示\"](\"https://muchongimg.xmcimg.com/data/bcs/2014/1024/w81h1780300_1414162863_531.jpg#opennewwindow\") 想求助下大家，有沒有什么方法讓這樣跨越周期的鍵不顯示了 |
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2樓2014-10-28 20:42:10
3樓2014-10-29 09:14:20
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wj925806: 金幣+10, ★有幫助 2014-10-31 09:34:57
wj925806: 金幣+10, ★有幫助 2014-10-31 09:34:57
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如果你知道晶胞參數(shù)，x/y/z/alpha/beta/gamma，可以借助VMD內(nèi)置的pbctool工具箱，設(shè)置其邊界。 可直接在vmd控制臺(tái)或者Tk控制臺(tái)（Main menu->Extensions->Tk Console）中輸入以下命令： pbc set {a b c alpha beta gamma} -all pbc -unwrap 可以將此晶胞內(nèi)原子脫除周期性 pbc box -on 可顯示晶胞邊界 |
4樓2014-10-31 00:17:02
5樓2014-10-31 09:36:29
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