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[求助]
VMD如何讓跨越周期的鍵不顯示 已有1人參與
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大家好!VMD里面,當(dāng)一個分子到盒子邊界處并跨越了盒子的邊界,若果分子內(nèi)如果所有鍵都顯示的話,跨越邊界的鍵就會把整個圖像弄亂,如下面的圖所示, 想求助下大家,有沒有什么方法讓這樣跨越周期的鍵不顯示了 |
新蟲 (初入文壇)
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如果你知道晶胞參數(shù),x/y/z/alpha/beta/gamma,可以借助VMD內(nèi)置的pbctool工具箱,設(shè)置其邊界。 可直接在vmd控制臺或者Tk控制臺(Main menu->Extensions->Tk Console)中輸入以下命令: pbc set {a b c alpha beta gamma} -all pbc -unwrap 可以將此晶胞內(nèi)原子脫除周期性 pbc box -on 可顯示晶胞邊界 |
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