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春華秋實2020

金蟲 (正式寫手)

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[求助] gauss 03 lanl2dz 計算Cs時，能計算NBO電荷嗎？

我嘗試計算文獻的結(jié)果，采用lanl2dz計算Cs2-NO3-3結(jié)構(gòu)，想知道NBO電荷，但是計算時只要有pop=NBO就出錯，
“Subroutine NAOANL could not find a d-type valence orbital on atom Cs 9�！�
輸入文件也改了很多次，有寫贗勢名稱的，也有直接寫贗勢的，無論那種方法都是同樣的問題，不計算NBO就可以正常計算。所以想問問，是不是gauss03使用贗勢時，不能計算NBO？
1、贗勢名稱
# opt  freq=raman b3lyp gen Pseudo=read geom=connectivity  iop(6/76=8) pop=nbo
分子結(jié)構(gòu)
******
Cs 0
lanl2dz
********
（空行）
Cs  0
lanl2dz

至少空兩行
2、直接寫贗勢
%chk=Cs-2-NO3-3-anion-singp.chk
%nproc=8
%mem=1850MB
# b3lyp/gen  Pseudo=read pop=NBO geom=connectivity

Cs-2-NO3-3-anion

-1 1
N                -0.00027700 1.96184600 -0.09393800
O                -1.08709000 2.57155100 -0.18683700
O                -0.00132000 0.68957800 0.00826800
O                1.08752100 2.57687100 -0.10008300
N                -6.39449300 -1.39394400 0.12925500
O                -5.35059300 -2.04603900 -0.18674100
O                -6.28248600 -0.15158000 0.37146600
O                -7.49440200 -1.95563200 0.19922600
Cs             -3.23421900 0.22605100 -0.07914100
N                6.40089600 -1.38339000 -0.01109000
O                5.44935400 -1.78427100 -0.75165500
O                6.19264700 -0.39683000 0.76241700
O                7.50490200 -1.94050900 -0.04230000
Cs                3.23074400 0.23219000 0.06532900

1 2 1.5 3 1.5 4 1.5
2 9 1.0
3
4 14 1.0
5 6 1.5 7 1.5 8 1.5
6 9 1.0
7 9 1.0
8
9
10 11 1.5 12 1.5 13 1.5
11 14 1.0
12 14 1.0
13
14

N O 0
6-311++g(2d)
****
Cs    0
S 3 1.00
   0.8709000          -1.1604798
   0.5393000             1.4198515
   0.1724000             0.5872905
S 4 1.00
   0.8709000             0.8237727
   0.5393000          -1.0709181
   0.1724000          -0.9085122
   0.0393000             1.0774049
S 1 1.00
   0.0151000             1.0000000
P 3 1.00
   1.4680000          -0.1321033
   0.4134000             0.6572410
   0.1536000             0.4756456
P 2 1.00
   0.1458000          -0.1680556
   0.0279000             1.0665746
P 1 1.00
   0.0113000             1.0000000
****

Cs  0
CS-ECP    3    46
f-ul potential
  6
0 636.7840130          -0.0805109
1 147.8912446          -33.4311448
2    42.5724911          -193.9270887
2    11.2427883          -56.8301433
2    3.5689707          -18.6504975
2    1.3107462          -2.5411399
s-ul potential
  3
0    40.8648070             3.0499934
1    10.9329329          37.9677514
2    2.2294903          45.2340673
p-ul potential
  4
0 118.8598171             4.6406951
1    30.6847958          62.0313533
2    10.1762999          129.5909481
2    1.8272850          31.5186825
d-ul potential
  4
0    16.0081704             7.3054473
1    2.6488291          33.2785760
2    14.5555672          53.1296948
2    0.6703604          16.2118878



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1樓 2014-11-11 20:44:59

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xieshen0321

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
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春華秋實2020: 金幣+2 2014-11-11 22:00:03

關(guān)鍵字：b3lyp/genecp pop=nbo
你只寫了Cs的基組，其他原子的基組呢？？

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2樓2014-11-11 20:58:38

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我給省略了，完整的是這樣的
%chk=Cs-2-NO3-3-anion.chk
%nproc=8
%mem=1850MB
# opt  freq=raman b3lyp gen Pseudo=read geom=connectivity

Cs-2-NO3-3-anion

-1 1
N                3.46570000 0.51170000 -0.69720000
O                2.59060000 1.12460000 -1.34940000
O                3.14400000 -0.29600000 0.22720000
O                4.66050000 0.72720000 -0.99250000
N                -3.41700000 0.04800000 -0.03680000
O                -2.86640000 -0.78110000 0.75280000
O                -2.86530000 0.87050000 -0.83580000
O                -4.65690000 0.04170000 -0.03870000
Cs             -0.03790000 0.04310000 -0.03710000
N                9.22190000 -2.21910000 1.86930000
O                8.26320000 -2.83540000 2.42830000
O                9.17800000 -1.29100000 1.00370000
O                10.35480000 -2.59020000 2.21240000
Cs                6.12850000 -1.22400000 0.96130000

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0
2 9 1.0
3 9 1.0
4
5 6 1.0 7 1.0 8 1.0
6 9 1.0
7 9 1.0
8
9
10 11 1.0 12 1.0 13 1.0
11 14 1.0
12 14 1.0
13
14

N O 0
6-311++g(2d)
****
Cs 0
lanl2dz
****

Cs 0
lanl2dz

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3樓2014-11-11 21:59:40

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引用回帖:

3樓: Originally posted by 春華秋實2020 at 2014-11-11 21:59:40
我給省略了，完整的是這樣的
%chk=Cs-2-NO3-3-anion.chk
%nproc=8
%mem=1850MB
# opt freq=raman b3lyp gen Pseudo=read geom=connectivity

Cs-2-NO3-3-anion

-1 1
N 3.46570000 ...

你是只算NBO 還是 opt freq nbo一塊算的��？？

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4樓2014-11-11 22:22:47

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引用回帖:

4樓: Originally posted by xieshen0321 at 2014-11-11 22:22:47
你是只算NBO 還是 opt freq nbo一塊算的啊？？...

我開始是想一起計算，后來發(fā)現(xiàn)一起算NBO出錯，就先優(yōu)化及計算頻率了，

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5樓2014-11-11 22:35:39

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我從網(wǎng)上搜了一下，說要換成NBO5.9，我使用gauss03，能換嗎？

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6樓2014-11-12 09:33:34

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我從網(wǎng)上看到有計算Fe的例子，我試了一下，可以計算NBO，難道就只是對Cs不能算，不應(yīng)該這樣吧？

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7樓2014-11-12 14:10:32

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%chk=test.chk
%nproc=8
%mem=1850MB
# b3lyp/genecp 6D 10F GFinput IOP(6/7=3) pop=nbo freq=NoRaman scf

AlFe2

0 8
Al          0.000000 0.000000 1.803136
Fe          0.000000 1.201089 -0.450784
Fe          0.000000 -1.201089 -0.450784

Al 0
6-311++G(d)
****
Fe 0
lanl2dz
****

Fe 0
lanl2dz

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8樓2014-11-12 14:11:03

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我把AlFe2的輸入文件中Fe替換成其他元素，都試著算了一下，有的元素可以計算，有的就出錯，能算的有Ca,Ru,Co,不能算的有K，Rb，Cs。注意了一下，能算的這些元素在計算中都沒有用到l607.exe,不能算的都要使用l607.exe。應(yīng)該是607的問題，但是應(yīng)該怎么解決呢？網(wǎng)上似乎有將NBO5.0替換的，不知道是不是只有這種方法。

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9樓2014-11-12 17:54:11

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