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molx79新蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何用multiwfn來求密度差(某個體系的密度減去組成它的各個片段的密度)的極值。 已有1人參與
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我嘗試的例子是水二聚體和兩個單體水的密度差。(復(fù)合物(H2O)2.wfn;單體H2O-1.wfn和H2O-2.wfn) 想計算里面的某個原子周圍密度差的極值(文獻上叫most negative density difference values(e per bohr3)) 求詳細做法。以及默認的密度差的單位。 |
版主 (著名寫手)
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用multiwfn來求密度差,詳見:《使用Multiwfn作電子密度差圖》 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=3980314 默認的密度差的單位就是:(e per bohr^3)。 most negative(最負值)這樣的單點値,應(yīng)該沒有什么實際意義。因此將你的問題轉(zhuǎn)問sobereva博士,她說: “我不覺得最負的值有什么物理意義,畢竟那只是一個點的數(shù)值,說明不了什么問題。 想得到的話,先用主功能5照常做密度差以得到密度差格點數(shù)據(jù),算完之后屏幕上就有這樣的提示 The minimum is -0.93736224D+00 at -0.02387 0.03594 0.23631 (Bohr) 說明了整個空間中最負的值和那個點的位置。 但是他說“原子周圍”,這就比較含糊,因為沒有唯一的方法去劃分原子。如果用AIM方法定義原子的空間,從中找最負的值,Multiwfn倒是也能做,不過需要利用一些技巧才能實現(xiàn)(要用到盆分析)! 對于在空間分布的正値或負値區(qū)域,它們可能就分布在某個“原子周圍”,這時可以通過Multiwfn作盆分析,求得某個“原子周圍”正或負值的具體電子(電荷)數(shù)量,它是這個“原子周圍”增加或減少的電子(電荷)數(shù)量。 |
新蟲 (初入文壇)
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