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[求助]
求助關于激發(fā)態(tài)相關問題！——審稿意見回復求助！ 已有1人參與
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我之前投了一篇文章，是研究一個關環(huán)機理，采用傳統(tǒng)過渡態(tài)理論，分別對反應物R，過渡態(tài)TS, 產物P進行優(yōu)化和振動分析，并進行IRC驗證，確實連接反應物和產物，最后計算能量，得到反應活化能Ea.研究結果是在眾多關環(huán)反應路徑中找到最可能的一條路徑，并給出了活化能和產物的結構，紅外光譜 和熱力學數(shù)據(jù)。 以下是第二個審稿人提出的建議： Although uncomplicated, the authors did not gave a relatively overall analysis for the cyclization pathways, for instance, possible potential energy surfaces with different multiplicities(多重度), controlling factors in reaction processes (kinetic or thermodynamical), and so on. Those analyses should be done detailed based on the experimental conditions, ground-state thermochemical or excitation-state photochemical processes.（激發(fā)態(tài)光化學） 能理解字面意思，但是不太理解審稿人的意圖，因為我研究的都是基態(tài)的反應物，過渡態(tài)，產物，計算過程中電荷和自選多重度都是：0,1.并不涉及激發(fā)態(tài)的計算，可是審稿人卻要求我給出激發(fā)態(tài)計算這個關環(huán)機理的情況，而我不知道要怎樣著手進行研究，特請各位高手幫忙！感激之至！ |
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beefly
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【答案】應助回帖
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感謝參與，應助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+2 2014-11-19 04:25:58
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gmy1990: 金幣+2 2014-11-19 04:25:58
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如果三重態(tài)的垂直激發(fā)能很高（例如好幾個電子伏），就沒必要優(yōu)化了。即便三重態(tài)真的能量最低，與單態(tài)之間的能壘也應該很高，不影響單態(tài)的分析結果。 但是如果三重態(tài)的垂直激發(fā)能比較小，不優(yōu)化確實可能會出現(xiàn)問題。例如最近有一篇JACS上的文章研究化學反應，優(yōu)化的都是單重態(tài)，可是經(jīng)過我測試，發(fā)現(xiàn)結果幾乎都是錯的，因為大部分結構無論用什么方法算，都是三重態(tài)更穩(wěn)定。可是人家算了一個月能發(fā)JACS，自己算十個月只能投垃圾雜志，不公平的事情太多了。 |
9樓2014-11-18 22:51:53
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2樓2014-11-17 01:39:42
3樓2014-11-17 23:11:53
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4樓2014-11-17 23:49:39
送紅花一朵 |
謝謝！請問，計算三重態(tài)是否一定要用到激發(fā)態(tài)的方法，比如CI，CASSCF等，直接用b3lyp方法，并將電荷和多重度改為：0,3進行優(yōu)化和單點能的計算，是否可行？ 例如輸入文件： %chk=DAAT-1.chk %mem=1GB %nprocshared=4 #p b3lyp/6-311++g** opt freq=noraman geom=connectivity opt of DAAT-1 0 3 N 3.15191100 -0.81162200 -0.00007000 N 0.80820000 1.66622600 0.00024200 N -1.36548300 0.67261700 -0.00021900 N -1.50821200 -1.67665100 0.00015400 N 0.57274600 -0.70653000 0.00012100 N -2.74236700 -1.52044500 0.00002600 N 2.67990800 0.34102200 0.00004300 C -0.53374900 1.73287100 -0.00016500 N 3.72879700 -1.77652500 -0.00021600 N -3.86697000 -1.54190700 -0.00007200 C 1.28346300 0.42750700 0.00020500 C -0.74435300 -0.50287800 0.00009400 H -0.49927600 3.77096800 0.00107100 H -2.09407200 3.05031900 0.00064100 N -1.09264600 2.95863200 -0.00036800 1 7 2.0 9 3.0 2 8 1.5 11 1.5 3 8 1.5 12 1.5 4 6 2.0 12 1.0 5 11 1.5 12 1.5 6 10 3.0 7 11 1.0 8 15 1.5 9 10 11 12 13 15 1.0 14 15 1.0 15 若不對，請幫忙修改！非常感謝！ |
5樓2014-11-18 09:08:43
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