jayjeremyyu

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[求助] 求助VASP自帶NEB的INCAR設(shè)置。按照我的INCAR計(jì)算只有在01文件夾里有輸出文件已有2人參與

如題。。
各位前輩啊。幫幫忙啊。老師讓計(jì)算Li離子在正極材料中的遷移過程。沒有什么基礎(chǔ)，也沒有師兄能帶，老師也不懂。
我按照我設(shè)置的INCAR進(jìn)行計(jì)算，只有01子文件夾有輸出文件，其他文件夾都沒有輸出文件。之前看到的資料應(yīng)該是除了兩個(gè)端點(diǎn)外，其他的子文件夾都會(huì)有輸出文件的。
我是用nebmake.pl插入構(gòu)象的。
不是我不用CINEB，嘗試過編譯，總不成功。沒什么基礎(chǔ)，不會(huì)編譯vtstcode，我也不敢怎么硬來編譯，服務(wù)器很多人在用，編譯壞了不好交代。就放棄了，想用VASP自帶的。
我的INCAR如下：
System= LiMnO2
ISTART=0
ENCUT=400
PREC =normal
ISMEAR=0
SIGMA=0.05
GGA=PE; EDIFFG=-0.05
ICHARG=2
LREAL=Auto
NSW=5
ISIF=2
IBRION=1
IMAGES=7
SPRING=-5
NFREE=2
LSCALAPACK=.FALSE
希望各位能幫幫忙啊。一直都沒有結(jié)果，快開組會(huì)了，再?zèng)]有一點(diǎn)結(jié)果老師就要罵人了。

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1樓 2014-12-06 23:44:26

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春華秋實(shí)538

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jayjeremyyu: 金幣+10, ★★★很有幫助 2014-12-09 00:29:34

http://cms.mpi.univie.ac.at/wiki ... ic_Band_Calculation 你可以試試這個(gè)簡單的算例。我運(yùn)行過是沒問題的。另外你可以在你的目錄下面安裝VASP，不會(huì)對其他用戶造成影響。CNEB與NEB比較起來更加容易找到鞍點(diǎn)，反應(yīng)勢壘更加準(zhǔn)確。

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2樓2014-12-08 21:10:37

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jayjeremyyu

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2樓: Originally posted by 春華秋實(shí)538 at 2014-12-08 21:10:37
http://cms.mpi.univie.ac.at/wiki/index.php/Collective_jumps_of_a_Pt_adatom_on_fcc-Pt_%28001%29:_Nudged_Elastic_Band_Calculation 你可以試試這個(gè)簡單的算例。我運(yùn)行過是沒問題的。另外你可以在你的目錄下面安 ...

真的感謝你的回復(fù)，那我就敢放開手腳亂來了。凌晨12點(diǎn)后才看到你的回復(fù)。還有一個(gè)問題，計(jì)算neb需要并行版的vasp是嗎？你有相關(guān)關(guān)于并行版vasp編譯的資料嗎？？謝謝。。

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3樓2014-12-09 00:29:14

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3樓: Originally posted by jayjeremyyu at 2014-12-09 00:29:14
真的感謝你的回復(fù)，那我就敢放開手腳亂來了。凌晨12點(diǎn)后才看到你的回復(fù)。還有一個(gè)問題，計(jì)算neb需要并行版的vasp是嗎？你有相關(guān)關(guān)于并行版vasp編譯的資料嗎？？謝謝。。...

當(dāng)然得要并行的了，不同的images提交到不同和核上或者節(jié)點(diǎn)上，直接都有communication.并行的安裝方法，小木蟲上有很多資源，可以試著搜索下。

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4樓2014-12-09 01:48:10

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jayjeremyyu: 金幣+5, ★★★很有幫助 2014-12-09 10:25:29

當(dāng)小木蟲上有很多資源，可以試著搜索下不同的images提交到不同和核上或者節(jié)點(diǎn)上，直接都有communication，

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在路上

5樓2014-12-09 08:48:35

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5樓: Originally posted by 空明之小 at 2014-12-09 08:48:35
當(dāng)小木蟲上有很多資源，可以試著搜索下不同的images提交到不同和核上或者節(jié)點(diǎn)上，直接都有communication，

直接都有communication是什么意思�。�？不知道。。能不能說得直白些啊。。是真的不懂。以前不做電腦模擬，半路出家的，什么都不懂。還有，那個(gè)服務(wù)器上的vasp是串行的，那我在我自己的目錄下安裝并行的時(shí)候還需要重新編譯那些ifort的東西嗎？

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6樓2014-12-09 10:25:08

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引用回帖:

6樓: Originally posted by jayjeremyyu at 2014-12-09 10:25:08
直接都有communication是什么意思��？？不知道。。能不能說得直白些啊。。是真的不懂。以前不做電腦模擬，半路出家的，什么都不懂。還有，那個(gè)服務(wù)器上的vasp是串行的，那我在我自己的目錄下安裝并行的時(shí)候還需要重 ...

節(jié)點(diǎn)之間都有通訊（數(shù)據(jù)互通）。你可以參照下這個(gè)帖子http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7578359&fpage=1&target=blank 安裝vasp

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7樓2014-12-10 00:24:06

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