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[求助] 請教siesta編譯“Error in opening the compiled module file”錯(cuò)誤問題

請教siesta編譯“Error in opening the compiled module file”錯(cuò)誤問題，看到有的論壇上說是linux系統(tǒng)中對庫函數(shù)的調(diào)用問題，請教如何解決，還請各位大蝦指教。謝謝！�。。。。。。。�！

錯(cuò)誤如下：

Hit ^C to abort...

==> Incorporating information about present compilation (compiler and flags)
make[1]: Entering directory `/root/Desktop/siesta/siesta-3.2/Obj'
mpif90 -c -i-static -g -O2 `FoX/FoX-config --fcflags` -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT  -DMPI  compinfo.F90
make[1]: Leaving directory `/root/Desktop/siesta/siesta-3.2/Obj'
#@rm -f compinfo.F90

mpif90 -c -i-static -g -O2 `FoX/FoX-config --fcflags` -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT  -DMPI /root/Desktop/siesta/siesta-3.2/Src/sys.F
/root/Desktop/siesta/siesta-3.2/Src/sys.F(23): error #7002: Error in opening the compiled module file.  Check INCLUDE paths. [MPI_SIESTA]
   use mpi_siesta
----------^
/root/Desktop/siesta/siesta-3.2/Src/sys.F(42): error #7002: Error in opening the compiled module file.  Check INCLUDE paths. [MPI_SIESTA]
   use mpi_siesta
----------^
/root/Desktop/siesta/siesta-3.2/Src/sys.F(81): error #7002: Error in opening the compiled module file.  Check INCLUDE paths. [MPI_SIESTA]
   use mpi_siesta
----------^
compilation aborted for /root/Desktop/siesta/siesta-3.2/Src/sys.F (code 1)
make: *** [sys.o] 錯(cuò)誤 1

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1樓 2014-12-07 15:38:00

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★
ljw4010: 金幣+1, 謝謝交流！ 2014-12-07 22:05:55

不妨makefile貼來看看，報(bào)錯(cuò)報(bào)的是include，估計(jì)mpi的include的路徑設(shè)置有問題。

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2樓2014-12-07 16:00:31

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引用回帖:

2樓: Originally posted by 卡開發(fā)發(fā) at 2014-12-07 16:00:31
不妨makefile貼來看看，報(bào)錯(cuò)報(bào)的是include，估計(jì)mpi的include的路徑設(shè)置有問題。

以下是make文件，麻煩幫忙看看，是不是MPI_INTERFACE和MPI_INCLUDE不對，用的是openmpi的，謝謝！�。。�！

SIESTA_ARCH=x86_64-unknown-linux-gnu--unknown

FPP=
FPP_OUTPUT=
FC=mpif90
RANLIB=ranlib

SYS=nag

SP_KIND=4
DP_KIND=8
KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND)

FFLAGS=-i-static -g -O2
FPPFLAGS= -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT  -DMPI
LDFLAGS=

ARFLAGS_EXTRA=

FCFLAGS_fixed_f=
FCFLAGS_free_f90=
FPPFLAGS_fixed_F=
FPPFLAGS_free_F90=

BLAS_LIBS=-L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_solver_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lguide
LAPACK_LIBS=-L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_sequential -lmkl_core
BLACS_LIBS=-L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_blacs_openmpi_lp64
SCALAPACK_LIBS=-L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64

COMP_LIBS=

NETCDF_LIBS=
NETCDF_INTERFACE=

LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS)

#SIESTA needs an F90 interface to MPI
#This will give you SIESTA's own implementation
#If your compiler vendor offers an alternative, you may change
#to it here.libvt-mpi-unify.a.
MPI_INTERFACE=libmpi_f90.a
MPI_INCLUDE=/root/Desktop/siesta/openmpi-1.3.4/soft/include

#Dependency rules are created by autoconf according to whether
#discrete preprocessing is necessary or not.
.F.o:
$(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F)  $<
.F90.o:
$(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $<
.f.o:
$(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f)  $<
.f90.o:
$(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90)  $<

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3樓2014-12-07 17:18:52

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3樓: Originally posted by 雁兒霏霏 at 2014-12-07 17:18:52
以下是make文件，麻煩幫忙看看，是不是MPI_INTERFACE和MPI_INCLUDE不對，用的是openmpi的，謝謝�。。。�！

SIESTA_ARCH=x86_64-unknown-linux-gnu--unknown

FPP=
FPP_OUTPUT=
FC=mpif90
RANLIB=ranlib
...

makefile看起來沒啥問題，不過我不確定你的openmpi的路徑是否正確。
過程應(yīng)該是先安裝openmpi，./configure CC=gcc FC=ifort --prefix=....
make && make install
不過我不是很確定你這里的include的路徑是不是$PREFIX/include。

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4樓2014-12-07 19:17:56

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4樓: Originally posted by 卡開發(fā)發(fā) at 2014-12-07 19:17:56
makefile看起來沒啥問題，不過我不確定你的openmpi的路徑是否正確。
過程應(yīng)該是先安裝openmpi，./configure CC=gcc FC=ifort --prefix=....
make && make install
不過我不是很確定你這里的include的路 ...

忽然發(fā)現(xiàn)$PREFIX/include是對的，但是沒有l(wèi)ibmpi_f90.a。
是不是編譯openmpi錯(cuò)誤？但是編譯也通過了，跟你說的步驟一致。

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5樓2014-12-07 20:31:28

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5樓: Originally posted by 雁兒霏霏 at 2014-12-07 20:31:28
忽然發(fā)現(xiàn)$PREFIX/include是對的，但是沒有l(wèi)ibmpi_f90.a。
是不是編譯openmpi錯(cuò)誤？但是編譯也通過了，跟你說的步驟一致。...

libmpi_f90.a應(yīng)該只是出現(xiàn)在$siesta/Obj下面，從makefile的路徑來看沒錯(cuò)。

是應(yīng)該檢查一下openmpi的編譯有沒有問題。這個(gè)僅僅通過描述我也查不出什么錯(cuò)。

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6樓2014-12-07 20:48:50

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你的openmpi的位置比較奇怪，但makefile文件本身應(yīng)該沒啥問題。
怎么用起來siesta了

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7樓2015-03-24 17:55:10

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