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糊涂仙8889木蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助2基因互作基因定位 已有2人參與
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最近研究發(fā)現(xiàn)有一個(gè)性狀是由2個(gè)顯性基因控制的,而且這2個(gè)基因表現(xiàn)為互作關(guān)系。 求助:我選用什么樣的方法進(jìn)行基因定位而達(dá)到克隆基因的目的?(該作物基因組測(cè)序已經(jīng)完成) 非常感謝! [ Last edited by 糊涂仙8889 on 2014-12-28 at 14:50 ] |

銅蟲 (正式寫手)

| 你得先說明你的結(jié)論是怎么得出來(lái)的,兩個(gè)顯性基因控制,互作關(guān)系,這種表達(dá)不是很明確。如果是用數(shù)量性狀遺傳遺傳體系分析出來(lái)的,那我可以理解為,這個(gè)性狀為數(shù)量性狀,由兩個(gè)主效基因控制,兩個(gè)主效基因均有顯性效應(yīng),同時(shí)兩個(gè)基因之間還有上位性效應(yīng)。這樣的話,那后面的路還很長(zhǎng),你得先做qtl定位,明確兩個(gè)基因所在的連鎖群(染色體),然后在雜交后代或者回交后代中尋找兩個(gè)基因分離的群體,分別以定位質(zhì)量性狀的方法對(duì)這兩個(gè)基因作圖。細(xì)節(jié)復(fù)雜,路途遙遠(yuǎn),可能要做好多年才能真正在基因組中找到基因(除非你做的是模式植物而且運(yùn)氣很好),希望能幫到你,祝你好運(yùn)。 |
木蟲 (小有名氣)

木蟲 (小有名氣)

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正規(guī)做法是做QTL定位。 你這個(gè)情況可以試試BSA法,先在親本間篩多態(tài)性標(biāo)記(最好是已知連鎖圖譜上的共顯性標(biāo)記,這樣就不需要重新作圖了),建抗感池,篩出來(lái)的標(biāo)記跑一邊。顯性抗病有兩個(gè),所以比較亂,但感池里面能得到一些結(jié)果,就是和抗/感病基因連鎖的標(biāo)記,應(yīng)該集中在連鎖群的兩個(gè)位置,然后在感病群體里簡(jiǎn)單作圖算個(gè)交換律,得出遺傳距離,這樣大概粗定位就算完成了。 |
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