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糊涂仙8889木蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助2基因互作基因定位 已有2人參與
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最近研究發(fā)現(xiàn)有一個(gè)性狀是由2個(gè)顯性基因控制的，而且這2個(gè)基因表現(xiàn)為互作關(guān)系。 求助：我選用什么樣的方法進(jìn)行基因定位而達(dá)到克隆基因的目的？（該作物基因組測序已經(jīng)完成） 非常感謝！ [ Last edited by 糊涂仙8889 on 2014-12-28 at 14:50 ] |
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2013101102
銅蟲 (正式寫手)
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2樓2014-12-29 21:32:32
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
糊涂仙8889: 金幣+20, ★有幫助 2014-12-31 10:18:37
糊涂仙8889: 金幣+20, ★有幫助 2014-12-31 10:18:37
| 你得先說明你的結(jié)論是怎么得出來的，兩個(gè)顯性基因控制，互作關(guān)系，這種表達(dá)不是很明確。如果是用數(shù)量性狀遺傳遺傳體系分析出來的，那我可以理解為，這個(gè)性狀為數(shù)量性狀，由兩個(gè)主效基因控制，兩個(gè)主效基因均有顯性效應(yīng)，同時(shí)兩個(gè)基因之間還有上位性效應(yīng)。這樣的話，那后面的路還很長，你得先做qtl定位，明確兩個(gè)基因所在的連鎖群（染色體），然后在雜交后代或者回交后代中尋找兩個(gè)基因分離的群體，分別以定位質(zhì)量性狀的方法對這兩個(gè)基因作圖。細(xì)節(jié)復(fù)雜，路途遙遠(yuǎn)，可能要做好多年才能真正在基因組中找到基因（除非你做的是模式植物而且運(yùn)氣很好），希望能幫到你，祝你好運(yùn)。 |
3樓2014-12-30 11:36:45
糊涂仙8889
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4樓2014-12-31 10:15:48
糊涂仙8889
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5樓2014-12-31 10:21:52
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
糊涂仙8889: 金幣+10, ★★★很有幫助, 是否有這方面的文獻(xiàn)可參考 2015-01-01 09:37:30
糊涂仙8889: 金幣+10, ★★★很有幫助, 是否有這方面的文獻(xiàn)可參考 2015-01-01 09:37:30
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正規(guī)做法是做QTL定位。 你這個(gè)情況可以試試BSA法，先在親本間篩多態(tài)性標(biāo)記（最好是已知連鎖圖譜上的共顯性標(biāo)記，這樣就不需要重新作圖了），建抗感池，篩出來的標(biāo)記跑一邊。顯性抗病有兩個(gè)，所以比較亂，但感池里面能得到一些結(jié)果，就是和抗/感病基因連鎖的標(biāo)記，應(yīng)該集中在連鎖群的兩個(gè)位置，然后在感病群體里簡單作圖算個(gè)交換律，得出遺傳距離，這樣大概粗定位就算完成了。 |
6樓2014-12-31 15:33:30
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