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Gaussian 【勢(shì)能面】 【新手】為什么我的過渡態(tài)勢(shì)能面掃描沒有鞍點(diǎn)？
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這個(gè)過渡態(tài)我掃描過freq，只有一個(gè)虛頻；然后IRC掃出來能量作圖是一個(gè)饅頭峰的形狀（據(jù)說這樣就表示這個(gè)的確是過渡態(tài)？） 接著開始掃描，我用scan和opt(modredundant)都掃過，然后用matlab查看勢(shì)能面。scan掃出來直接一個(gè)斜坡連最低點(diǎn)都沒有，opt(modredundant)掃出來是一個(gè)最低點(diǎn)，都沒有馬鞍形T T。(我的坐標(biāo)都是直接從CHEM3D里面拷出來的，然后按照標(biāo)的原子序數(shù)調(diào)好順序)，沒有Gaussian View。 以下是modredundant的 我是把掃描的過渡態(tài)的兩個(gè)變量稍微調(diào)小了一點(diǎn)然后掃描的modredundant，都覆蓋了理論值 #B3LYP/6-31G opt(modredundant) T1 0 1 C 2.868 -0.138 0.265 C 1.611 -1.065 0.402 C 0.576 -0.286 -0.394 N 0.824 1.143 0.074 C 2.314 1.299 -0.026 C -0.962 -0.372 -0.352 O -1.602 -1.422 -0.182 O -1.420 0.864 -0.574 O 3.666 -0.467 -0.906 H 3.489 -0.162 1.169 H 1.308 -1.173 1.451 H 1.806 -2.061 0.001 H 0.873 -0.295 -1.451 H 0.551 1.205 1.062 H 2.587 1.571 -1.047 H 2.666 2.061 0.669 H 4.176 -1.289 -0.763 H -0.159 0.968 -0.419 O -4.176 0.199 -0.052 H -3.824 -0.712 -0.022 H -3.409 0.751 -0.314 17 4 S 10 0.02 17 8 S 10 0.02 以下是scan的 #B3LYP/6-31G scan t1 0 1 C C 1 1.568 C 2 1.521 1 101.354 N 3 1.524 2 102.041 1 -43.175 C 1 1.567 2 105.936 3 23.912 C 3 1.541 2 129.534 4 101.961 O 6 1.242 3 124.474 2 -36.040 O 1 1.455 2 112.118 5 104.600 H 1 1.097 2 111.589 5 111.921 H 2 1.097 1 111.310 3 111.277 H 2 1.092 1 111.366 3 113.355 H 3 1.099 2 108.393 4 105.066 H 4 1.027 3 107.961 5 108.833 H 5 1.091 1 108.256 4 109.719 H 5 1.090 1 114.095 4 110.541 H 4 R1 3 91.51 6 -33.21 O 16 R2 3 106.605 7 128.886 H 8 0.978 1 111.009 2 -74.833 O 17 2.883 6 94.853 3 -173.051 H 19 0.978 1 66.082 2 -10.243 H 19 0.981 20 104.520 1 17.603 R1 1.1000 10 0.02 R2 1.2000 10 0.02 1-10就要交作業(yè)啦T T 大神們求助�。。∫呀�(jīng)掃了一周失敗了 我現(xiàn)在也不知道怎么弄，就不停地?fù)Q變量嘗試，鍵長鍵角，二面角什么的都試過了(之前主要嘗試scan，接下來想試modredundant，主要modredundant太慢了)，scan的結(jié)果總是一個(gè)斜坡，連最低點(diǎn)都沒有…… 貼圖是modredundant在matlab里面掃出來的東東(matlab程序老師編的)，其實(shí)那個(gè)modredundant看上去還蠻像馬鞍形的 是不是我把勢(shì)能面掃大一點(diǎn)就能出來形狀 - - untitled.jpg |
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