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[求助]
作MOF的蒙特卡羅模擬吸附小分子時CIF文件有無序結(jié)構(gòu)時如何處理 已有1人參與
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最近在用MS7.0的Sorption模塊做MC時，從CCDC上下載CIF文件建模的時候發(fā)現(xiàn)多個結(jié)構(gòu)有很多無序結(jié)構(gòu)，比如同一個苯環(huán)出現(xiàn)了多個重疊，我知道這是由于做XRD，解單晶時反映的一個整體結(jié)構(gòu)時由于同一個重復單元在不同的晶胞里面的位置不用造成的，反映到CIF文件中就是同一個位置出現(xiàn)多個相同的結(jié)構(gòu)，而且都有一定的占有率。更明顯的是一個甲基上的三個H在CIF中反映為6個H，其占有率均為50%，刪除其中一個另外一個也跟著被刪除了。那我的問題是我們在拿這種CIF文件做MC模擬的時候，有沒有必要人為的將這些無序和不符合化學常識的情況調(diào)整過來？如果需要調(diào)整的話，是不是每一種占有率情況下的結(jié)構(gòu)都要做一次模擬？ 各位做MC的大牛，小弟剛剛接觸這個，請大家多多指教！ |
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3樓2015-01-08 22:02:39
2樓2015-01-08 20:44:26
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