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tina2013liti新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
怎樣提交序列到NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)，菌種描述怎么寫(xiě) 已有2人參與
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本人菜鳥(niǎo)一枚，因論文需要，要提交自己檢測(cè)的16s rDNA序列到NCBI數(shù)據(jù)，但是不知道用Banklt還是用sequin更適合? 樣品為環(huán)境樣品，經(jīng)過(guò)DGGE，割膠測(cè)序，序列在上海生工測(cè)的，對(duì)方在RDP數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行了比對(duì)，我根據(jù)自己測(cè)出的序列在GENBAND數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì),我在提交序列的時(shí)候，F(xiàn)ASTA文件不知道怎么寫(xiě)，菌種名稱(chēng)怎么寫(xiě)呢，寫(xiě)比對(duì)的結(jié)果例如unclassified_Burkholderiales_incertae_sedis，還是寫(xiě)Uncultured bacterium clone 16S ribosomal RNA gene, partial sequence。下圖1中是上海生工的測(cè)序和比對(duì)結(jié)果，下圖2是我在genbanK比對(duì)結(jié)果，請(qǐng)問(wèn)這個(gè)的描述改怎么寫(xiě)呢？ 凡是測(cè)得的數(shù)據(jù)都可以上傳是嗎，會(huì)不會(huì)跟數(shù)據(jù)庫(kù)中原有數(shù)據(jù)有重復(fù)呢？ 感激涕零 1.jpg 2.jpg |
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zhaoyanqin15
鐵蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 18.6
- 帖子: 5
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- 蟲(chóng)號(hào): 3746825
- 注冊(cè): 2015-03-15
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2樓2015-03-18 05:06:35
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