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tina2013liti新蟲 (初入文壇)
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[求助]
怎樣提交序列到NCBI數(shù)據(jù)庫，菌種描述怎么寫 已有2人參與
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本人菜鳥一枚，因論文需要，要提交自己檢測的16s rDNA序列到NCBI數(shù)據(jù)，但是不知道用Banklt還是用sequin更適合? 樣品為環(huán)境樣品，經(jīng)過DGGE，割膠測序，序列在上海生工測的，對方在RDP數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行了比對，我根據(jù)自己測出的序列在GENBAND數(shù)據(jù)庫中比對,我在提交序列的時候，F(xiàn)ASTA文件不知道怎么寫，菌種名稱怎么寫呢，寫比對的結(jié)果例如unclassified_Burkholderiales_incertae_sedis，還是寫Uncultured bacterium clone 16S ribosomal RNA gene, partial sequence。下圖1中是上海生工的測序和比對結(jié)果，下圖2是我在genbanK比對結(jié)果，請問這個的描述改怎么寫呢？ 凡是測得的數(shù)據(jù)都可以上傳是嗎，會不會跟數(shù)據(jù)庫中原有數(shù)據(jù)有重復(fù)呢？ 感激涕零 1.jpg 2.jpg |
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2樓2015-03-18 05:06:35
3樓2015-12-09 23:30:03
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