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guxing.2010銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
投稿有經(jīng)驗的蟲友幫忙看看我該如何回復(fù)審稿人的問題。 已有1人參與
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小弟在frontiers in microbiology上投了一篇轉(zhuǎn)錄分析的文章，開始審稿人對我取樣過程有疑問，我補上取樣部分試驗后。他又對我轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)的生物學(xué)統(tǒng)計能否支持我的生物現(xiàn)象有疑問，再加上審稿人給我提的建議，我真是不知道如何回復(fù)了？ （轉(zhuǎn)錄分析找華大做的，編輯的建議雖好，但是我們實驗室沒有相關(guān)基礎(chǔ)�。�Q31.JPG [ Last edited by guxing.2010 on 2015-1-14 at 22:38 ] |
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guxing.2010
銅蟲 (初入文壇)
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2樓2015-03-04 21:04:05
glin08
至尊木蟲 (文壇精英)
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3樓2015-03-04 21:07:23
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【答案】應(yīng)助回帖
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我不知道你所說的轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)具體是怎么做的，估計是microarray？嚴(yán)格說來叫轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)不見得合適。Anyway，審稿人2顯然對這一套本身也不是非常熟悉。當(dāng)然他提出的問題是對的，尤其對不太熟悉的人來說。但這個問題靠mRNA microarray本身是無法回答的，表達改變的數(shù)據(jù)僅僅是一個很大翻為的帥選。篩選之后需要做相關(guān)驗證（不可能對所有有表達差異的都一一驗證，只能選一下差異大的可能有興趣的進行驗證）。即便驗證完畢之后仍無法肯定這些變化就一定有或沒有biological significance。要回答這些問題單靠Editor所建議的方法仍然使一些預(yù)測，有幫助但不能回答這種問題。 這樣的問題真正回答只能回過頭來對具體的基因進行功能方面的實驗，如將內(nèi)源性基因knockout或knockdown之后細(xì)胞的表型改變或相關(guān)pathway的變化等，當(dāng)然也可以反過來讓某一基因高表達，看相應(yīng)變化。 按理說，一篇完整的論文應(yīng)該有這樣的內(nèi)容，但估計你文中缺少這部分，所有會提出這個問題。 我想回答也只能說：這的確是一個重要而又實際的問題，也是我們接下來要解決的問題之一。 |
4樓2015-03-04 23:28:02
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