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guxing.2010銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
投稿有經(jīng)驗(yàn)的蟲友幫忙看看我該如何回復(fù)審稿人的問題。 已有1人參與
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小弟在frontiers in microbiology上投了一篇轉(zhuǎn)錄分析的文章，開始審稿人對(duì)我取樣過程有疑問，我補(bǔ)上取樣部分試驗(yàn)后。他又對(duì)我轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)的生物學(xué)統(tǒng)計(jì)能否支持我的生物現(xiàn)象有疑問，再加上審稿人給我提的建議，我真是不知道如何回復(fù)了？ （轉(zhuǎn)錄分析找華大做的，編輯的建議雖好，但是我們實(shí)驗(yàn)室沒有相關(guān)基礎(chǔ)�。�Q31.JPG [ Last edited by guxing.2010 on 2015-1-14 at 22:38 ] |
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ssssllllnnnn 
至尊木蟲 (知名作家)
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【答案】應(yīng)助回帖
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我不知道你所說的轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)具體是怎么做的，估計(jì)是microarray？嚴(yán)格說來叫轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)不見得合適。Anyway，審稿人2顯然對(duì)這一套本身也不是非常熟悉。當(dāng)然他提出的問題是對(duì)的，尤其對(duì)不太熟悉的人來說。但這個(gè)問題靠mRNA microarray本身是無法回答的，表達(dá)改變的數(shù)據(jù)僅僅是一個(gè)很大翻為的帥選。篩選之后需要做相關(guān)驗(yàn)證（不可能對(duì)所有有表達(dá)差異的都一一驗(yàn)證，只能選一下差異大的可能有興趣的進(jìn)行驗(yàn)證）。即便驗(yàn)證完畢之后仍無法肯定這些變化就一定有或沒有biological significance。要回答這些問題單靠Editor所建議的方法仍然使一些預(yù)測(cè)，有幫助但不能回答這種問題。 這樣的問題真正回答只能回過頭來對(duì)具體的基因進(jìn)行功能方面的實(shí)驗(yàn)，如將內(nèi)源性基因knockout或knockdown之后細(xì)胞的表型改變或相關(guān)pathway的變化等，當(dāng)然也可以反過來讓某一基因高表達(dá)，看相應(yīng)變化。 按理說，一篇完整的論文應(yīng)該有這樣的內(nèi)容，但估計(jì)你文中缺少這部分，所有會(huì)提出這個(gè)問題。 我想回答也只能說：這的確是一個(gè)重要而又實(shí)際的問題，也是我們接下來要解決的問題之一。 |
4樓2015-03-04 23:28:02
glin08
至尊木蟲 (文壇精英)
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3樓2015-03-04 21:07:23
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