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桃花瓔珞鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
可以用autodock將三個(gè)蛋白docking在一起么 已有2人參與
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大家好~ 我是結(jié)構(gòu)生物學(xué)的小渣一枚，現(xiàn)在的課題是A-B-C三個(gè)蛋白復(fù)合物，B作為橋梁連接A和C蛋白。 因?yàn)楸磉_(dá)的問(wèn)題，我做了B的截短，但是發(fā)現(xiàn)將三個(gè)蛋白過(guò)分子篩時(shí)，A-B和B-C兩兩結(jié)合，沒有A-B-C的三元復(fù)合物。 因此想是不是A-B的結(jié)合區(qū)域與B-C的結(jié)合區(qū)域重疊？ 現(xiàn)在已知A和C的結(jié)構(gòu)，也已知A-B與B-C結(jié)合的domian，那能不能先用rebetta預(yù)測(cè)出截短蛋白B的結(jié)構(gòu)，再利用autodock將三個(gè)蛋白docking在一起看看是否結(jié)合區(qū)域重疊了呢？ 多謝各位大神解答。   |
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 autodock |
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6樓2015-06-24 17:55:27
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