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小范范1989

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

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[交流] 高斯09優(yōu)化激發(fā)態(tài)并且計(jì)算激發(fā)態(tài)頻率的討論與求教。

先說(shuō)一下我的背景：點(diǎn)上計(jì)算資源有限，50多個(gè)人用一個(gè)很老的集群，有些老師感覺(jué)太滿，都自己帶電腦，用單機(jī)跑分子。
然后，我要計(jì)算的分子大約含有原子110個(gè)，曾經(jīng)，我計(jì)算一個(gè)分子（大約80個(gè)原子），激發(fā)態(tài)的頻率計(jì)算了半年，出來(lái)結(jié)果還有一個(gè)虛頻，我當(dāng)時(shí)的心，就和現(xiàn)在只穿一個(gè)背心逛街感覺(jué)是一樣的。
我的計(jì)算的最終目的是：我需要的是基態(tài)的頻率，還有激發(fā)態(tài)的頻率。

其次：說(shuō)一下我遇到的問(wèn)題
1：基態(tài)的優(yōu)化和頻率計(jì)算都是在b3lyp/6-31g*的基礎(chǔ)上完成的，還算很順利，沒(méi)有虛頻。耗時(shí)也不是很久。
2：優(yōu)化激發(fā)態(tài)，一直出錯(cuò)，采用的是b3lyp/6-31g*.我最近好多帖子都是問(wèn)這個(gè)問(wèn)題，相信很多蟲(chóng)友已經(jīng)見(jiàn)過(guò)了，基本都能看到我的陰魂。我在想，激發(fā)態(tài)優(yōu)化，我都優(yōu)化2個(gè)月，如果計(jì)算激發(fā)態(tài)的頻率，是不是要等我博6畢業(yè)才能出來(lái)？所以我等不起。
3:看了sob的帖子，說(shuō)激發(fā)態(tài)的優(yōu)化，可以采用pbe0，或者是m062x等，我這就不過(guò)多的累述了。給sob一個(gè)郵件，sob的回復(fù)是：
至于頻率計(jì)算，如果你在TDDFT下進(jìn)行，由于Gaussian沒(méi)有TDDFT解析二階導(dǎo)數(shù)，這是幾乎做不動(dòng)的，耗時(shí)我估計(jì)是600~1200次激發(fā)能計(jì)算的耗時(shí)。必須要計(jì)算頻率的話，只能是在CIS下優(yōu)化并計(jì)算頻率，因?yàn)镃IS下有解析二階導(dǎo)數(shù)，速度和TDDFT計(jì)算頻率耗時(shí)完全不在一個(gè)數(shù)量級(jí)。頻率對(duì)計(jì)算級(jí)別的敏感度遠(yuǎn)小于激發(fā)能，因此CIS下的頻率的準(zhǔn)確度應(yīng)當(dāng)沒(méi)問(wèn)題。
這是的想問(wèn)的主要問(wèn)題：sob建議我激發(fā)態(tài)的優(yōu)化和頻率的計(jì)算使用CIS是吧？我第一感覺(jué)，是不是CIS不更耗時(shí)？再就是，我激發(fā)態(tài)用cis，基態(tài)用b3lyp，然后拿這兩個(gè)頻率去進(jìn)行下一步的計(jì)算，（清華的momoap計(jì)算杜欣斯基轉(zhuǎn)動(dòng)矩陣）。能靠譜嗎？
還有一事就是，CIS計(jì)算，就是把我的b3lyp換成CIS就行了是吧？其他的輸入文件的地方不用改？
謝謝指點(diǎn)，謝謝。

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1樓 2015-01-14 17:18:24

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同時(shí)，我還有一個(gè)問(wèn)題：
我優(yōu)化出來(lái)了T1的結(jié)構(gòu)的方式是：
#p b3lyp/6-31* opt scf(maxcycle=500)

test

0 3

計(jì)算頻率我的方式是：
#p b3lyp/6-31* freq

test

0 3

都正常結(jié)束了，而且也沒(méi)有虛頻，不知道這樣的結(jié)果可靠不？

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2樓2015-01-15 00:00:24

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小范范1989: 金幣+10 2015-01-15 09:56:45

基態(tài)和激發(fā)態(tài)可以用不同的理論水平。CIS會(huì)比較不耗時(shí)，但是精確度不行，所以sob建議你激發(fā)態(tài)能量取DFT的，但是頻率可以用CIS的。
如果你T1的頻率是在T1的駐點(diǎn)結(jié)構(gòu)上算的話就沒(méi)有問(wèn)題了。

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3樓2015-01-15 08:53:31

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阿Q~~

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小范范1989: 金幣+10, 謝謝妹子 2015-01-15 09:56:55

路過(guò)的看了一下，幫頂~~~~~~~~~~~~~~~~~~

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4樓2015-01-15 09:31:18

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3樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2015-01-15 08:53:31
基態(tài)和激發(fā)態(tài)可以用不同的理論水平。CIS會(huì)比較不耗時(shí)，但是精確度不行，所以sob建議你激發(fā)態(tài)能量取DFT的，但是頻率可以用CIS的。
如果你T1的頻率是在T1的駐點(diǎn)結(jié)構(gòu)上算的話就沒(méi)有問(wèn)題了。

謝謝槍神的回復(fù)，我打算按照sob的指點(diǎn)試試，激發(fā)態(tài)我用cis優(yōu)化，并且算頻率。但是對(duì)于另外的參數(shù)，比如說(shuō)絕熱激發(fā)能和垂直激發(fā)能，我是不是應(yīng)該按照我的b3lyp/6-31g*的形式去找？但是，激發(fā)態(tài)6-31g*出不來(lái)，3-21g出來(lái)，能否用基態(tài)是b3lyp/6-31g*，激發(fā)態(tài)優(yōu)化是3-21g，來(lái)找絕熱激發(fā)能？
可是我感覺(jué)，我整個(gè)的計(jì)算的流程，基態(tài)和激發(fā)態(tài)優(yōu)化的方式不一樣，基泰和激發(fā)態(tài)頻率的方式不一樣，在進(jìn)行下一步，借助清華momap去算輻射躍遷，無(wú)輻射躍遷速率，這樣一系列的省略下來(lái)，不知道最后的結(jié)果和實(shí)驗(yàn)差不多少。一直擔(dān)心這個(gè)。
謝謝神槍的指點(diǎn)，后面的如果運(yùn)到其他我不能單獨(dú)解決的問(wèn)題，還希望您指點(diǎn)一二，thanks

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5樓2015-01-15 09:56:40

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對(duì)，還有一事相求：
我的優(yōu)化t1的表頭，采用的是0 3的方式，
優(yōu)化的時(shí)候也是 0 3，類似上面寫(xiě)的，
這個(gè)應(yīng)該沒(méi)問(wèn)題哈，第一次計(jì)算t1，還請(qǐng)您鑒定一下。
ps：結(jié)果很順利的出來(lái)了，沒(méi)有虛頻，耗時(shí)不是很長(zhǎng)。

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6樓2015-01-15 09:59:02

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5樓: Originally posted by 小范范1989 at 2015-01-15 09:56:40
謝謝槍神的回復(fù)，我打算按照sob的指點(diǎn)試試，激發(fā)態(tài)我用cis優(yōu)化，并且算頻率。但是對(duì)于另外的參數(shù)，比如說(shuō)絕熱激發(fā)能和垂直激發(fā)能，我是不是應(yīng)該按照我的b3lyp/6-31g*的形式去找？但是，激發(fā)態(tài)6-31g*出不來(lái)，3-21g出 ...

那6-31g可以出得來(lái)嗎？垂直激發(fā)能應(yīng)該沒(méi)問(wèn)題，畢竟不涉及結(jié)構(gòu)優(yōu)化。絕熱激發(fā)能是怎么個(gè)情況？我在理論上確實(shí)小白。。。
就像sob神說(shuō)的，如果你單單只需要頻率數(shù)據(jù)的話其精度的影響不會(huì)太大。
另外不好意思我看錯(cuò)了一點(diǎn)，你算的應(yīng)該是三重態(tài)的基態(tài)，也就是T0，如果是T1的話應(yīng)該用td(triplet)來(lái)算。T1的計(jì)算應(yīng)該也有很多老帖討論過(guò)的
最后cis的寫(xiě)法是替換td，不是b3lyp，如果我沒(méi)記錯(cuò)的話

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7樓2015-01-15 11:02:05

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7樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2015-01-15 11:02:05
那6-31g可以出得來(lái)嗎？垂直激發(fā)能應(yīng)該沒(méi)問(wèn)題，畢竟不涉及結(jié)構(gòu)優(yōu)化。絕熱激發(fā)能是怎么個(gè)情況？我在理論上確實(shí)小白。。。
就像sob神說(shuō)的，如果你單單只需要頻率數(shù)據(jù)的話其精度的影響不會(huì)太大。
另外不好意思我看錯(cuò) ...

謝謝神槍指點(diǎn)，我還有幾個(gè)問(wèn)題：
1：絕熱激發(fā)能，就是s1的穩(wěn)態(tài)能量和s0的穩(wěn)態(tài)能量之差，我當(dāng)時(shí)問(wèn)過(guò)，這個(gè)帖子：http://ccc.keinsci.com/forum.php ... =365&extra=
2：那我就采用sob的提議，CIS計(jì)算頻率。
3：難道以前我都理解錯(cuò)了？我以為我的這個(gè)方式就是優(yōu)化T1,
sob的回復(fù)：又是三重態(tài)又是root=1，直接用0 3計(jì)算就行了，不需要TDDFT，又快又不會(huì)出現(xiàn)這些問(wèn)題
我當(dāng)時(shí)在這個(gè)帖子問(wèn)過(guò)：
http://ccc.keinsci.com/forum.php ... =369&extra=
再就是，三重態(tài)基態(tài)，是T0？T0沒(méi)見(jiàn)過(guò)啊，我以前都認(rèn)為是t1，還請(qǐng)槍神指點(diǎn)。
4：我昨晚上看了看，是不是這樣寫(xiě) #p RCIS(root=1,nstates=40)/6-31g* opt freq

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8樓2015-01-15 12:05:19

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8樓: Originally posted by 小范范1989 at 2015-01-15 12:05:19
謝謝神槍指點(diǎn)，我還有幾個(gè)問(wèn)題：
1：絕熱激發(fā)能，就是s1的穩(wěn)態(tài)能量和s0的穩(wěn)態(tài)能量之差，我當(dāng)時(shí)問(wèn)過(guò)，這個(gè)帖子：http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=365&extra=
2：那我就采用sob的提議 ...

叫小弟“神”是在擔(dān)當(dāng)不起。。。
1、如果是這個(gè)意思的話那激發(fā)態(tài)要優(yōu)化的
3、這個(gè)嘛這兩個(gè)貌似都可以，這個(gè)問(wèn)題以前也有過(guò)討論，到底用哪種輸入，由于我三重態(tài)做得不多，所以也無(wú)法確切回答你，你可以按照sob教你的方法。
不知道氧氣的基態(tài)算不算T0？
4、應(yīng)該可以

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9樓2015-01-15 13:01:27

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9樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2015-01-15 13:01:27
叫小弟“神”是在擔(dān)當(dāng)不起。。。
1、如果是這個(gè)意思的話那激發(fā)態(tài)要優(yōu)化的
3、這個(gè)嘛這兩個(gè)貌似都可以，這個(gè)問(wèn)題以前也有過(guò)討論，到底用哪種輸入，由于我三重態(tài)做得不多，所以也無(wú)法確切回答你，你可以按照sob教你 ...

你就是很厲害，很早之前就關(guān)注你了，很多帖子你回復(fù)的都很好，而且很到位。你在我心里就是大神一樣的人物。

哈哈哈，謝謝你的幫助，希望以后常交流。謝謝你

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10樓2015-01-15 15:02:50

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