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iljosie金蟲 (小有名氣)
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[求助]
MS如文獻(xiàn)的建模問題
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my own 科研路 | MD Composite |
專家顧問 (著名寫手)
伊卡斯特的小豬
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金蟲 (小有名氣)
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伊卡斯特的小豬
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我的理解,這個(gè)流程圖只是一個(gè)建模思路,一般的建模軟件都可以適用,其中的判斷步驟可以寫程序也可以自己手動(dòng)判斷 我查了一些epoxy交聯(lián)建模的文獻(xiàn) A Molecular Dynamics Study of Epoxy-Based Networks Cross-Linking Procedure and Prediction of Molecular and Material Properties 也有類似的流程圖 |

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伊卡斯特的小豬
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Atomistic molecular modelling of crosslinked epoxy resin 有一個(gè)可以參考的建模過程 思路是把反應(yīng)單體處理為active結(jié)構(gòu) 放到AC盒子里 動(dòng)力學(xué)模塊跑平衡-equilibration過程 觀察可反應(yīng)點(diǎn)間距是否在可交聯(lián)范圍-pair found過程(cutoff,好像一些文獻(xiàn)會(huì)出4-10A) 可交聯(lián)點(diǎn)連接起來-form bond過程 重復(fù)跑平衡——交聯(lián)——平衡——交聯(lián)過程 最后模型建好后需要模擬一些性能與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)比對(duì) 附件是一些文獻(xiàn) 或許對(duì)你建模有幫助 |

金蟲 (小有名氣)
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金蟲 (小有名氣)
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金蟲 (小有名氣)
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非常感謝您的回答! 還有幾個(gè)問題想請(qǐng)教您一下: 1.我將二乙烯苯的乙烯上的C上的H原子刪掉后利用caculate bonds自動(dòng)成鍵,它們又重新生成了雙鍵,不是互相交聯(lián)的,這樣怎么辦?至于您說的手動(dòng)畫,如果單體的個(gè)數(shù)多,手動(dòng)畫是不是太麻煩? 2.如第一個(gè)圖所示流程圖思路的循環(huán)過程,沒有模塊能夠直接運(yùn)行嗎?我看了您發(fā)給我的文獻(xiàn),吳超富老師是寫了一個(gè)代碼運(yùn)行的,不能直接靠軟件本身來實(shí)現(xiàn)嗎? 問題比較多,再次感謝! |
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