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[交流]
HRM可以使用兼并引物嗎 已有2人參與
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初次設(shè)計(jì)HRM引物，希望對多態(tài)性較多的目標(biāo)基因檢測，針對特異的SNP，通用引物的位置不好設(shè)計(jì)，不知能否設(shè)計(jì)兼并引物？ 能否在擴(kuò)增片斷中包含位置相近的兩個(gè)SNP位點(diǎn)？這樣也能出來不同組合的HRM圖嗎？ 非常感謝！！ |
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2樓2015-01-22 12:08:45
★ ★ ★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
kx444555: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2015-01-22 16:44:05
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kx444555: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2015-01-22 16:44:05
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熒光pcr本來就要求條件挺嚴(yán)格的，hrm更嚴(yán)格一點(diǎn)，簡并引物有點(diǎn)說不過去。再說為什么要用簡并引物？SNP兩端序列還有未知的？那就拉長一點(diǎn)擴(kuò)出來看看啊。 一個(gè)擴(kuò)增產(chǎn)物里面包含兩個(gè)SNP位點(diǎn)，這個(gè)從理論上來講是可以的，HRM應(yīng)該可以區(qū)分AB,Ab,aB和ab的，就是說這四種型應(yīng)該有各自的溶解曲線。而且接近就不會有交換，沒有交換就是2個(gè)堿基的差別，溶解曲線的差別應(yīng)該比1個(gè)堿基差別還要大，所以就更可以了。 |
3樓2015-01-22 12:21:16
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