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[交流]
HRM可以使用兼并引物嗎 已有2人參與
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初次設(shè)計HRM引物,希望對多態(tài)性較多的目標基因檢測,針對特異的SNP,通用引物的位置不好設(shè)計,不知能否設(shè)計兼并引物? 能否在擴增片斷中包含位置相近的兩個SNP位點?這樣也能出來不同組合的HRM圖嗎? 非常感謝! |
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熒光pcr本來就要求條件挺嚴格的,hrm更嚴格一點,簡并引物有點說不過去。再說為什么要用簡并引物?SNP兩端序列還有未知的?那就拉長一點擴出來看看啊。 一個擴增產(chǎn)物里面包含兩個SNP位點,這個從理論上來講是可以的,HRM應(yīng)該可以區(qū)分AB,Ab,aB和ab的,就是說這四種型應(yīng)該有各自的溶解曲線。而且接近就不會有交換,沒有交換就是2個堿基的差別,溶解曲線的差別應(yīng)該比1個堿基差別還要大,所以就更可以了。 |
金蟲 (小有名氣)
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