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huangchj03金蟲 (小有名氣)
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[交流]
關(guān)于分子診斷試劑盒常遇到的概率問題
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| 這個統(tǒng)計學(xué)問題是我自己想的,拿出來請教一下:假設(shè)一個分子檢測試劑盒的DNA最低檢測濃度為10copies/反應(yīng),前提一,不考慮樣本提取過程中的富集作用;前提二,現(xiàn)提供驗證模板為200ul,濃度為5copies/ul,每反應(yīng)加樣2ul,問題是同時做20個平行實驗,17個以上為陽性的結(jié)果的概率是多少?為促進(jìn)交流和學(xué)習(xí),希望大家踴躍參與!我自己昨晚上也認(rèn)真的分析了一下,稍后會將分析結(jié)果公布,我希望能在這個版塊將這個問題徹底解決了 |
金蟲 (小有名氣)
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昨晚我自己認(rèn)真的計算了下,以下是我的計算過程: 第一:樣本滿足的是泊松分布,即描述在一定空間(長度、面積、體積)或一定時間間隔內(nèi)點子散布狀況的理想化模型,所以我認(rèn)為樣本滿足泊松分布,而不是正態(tài)分布。 第二:解答過程。 先求出每2ul樣本中平均質(zhì)粒數(shù)或DNA數(shù)μ=10coipes; 再求出每2ul樣本中有x個DNA的概率,P(x)=10∧x/x!e∧10,帶入x=0、1、2、3。。。 。。。,即可得出相應(yīng)的概率P(0)、P(1)、P(2)。。。 P(0)≈0.0000454;P(1)≈0.000454;P(2)≈0.00227;P(3)≈0.00756;P(4)≈0.0189; P(5)≈0.0378;P(6)≈0.0631;P(7)≈0.0901;P(8)≈0.1126;P(9)≈0.1251;P(10)≈0.1251;P(11)≈0.1137;P(12)≈0.0948;P(13)≈0.0729;P(14)≈0.0521;P(15)≈0.0347;P(16)≈0.0217;P(17)≈0.0128;P(18)≈0.00709;P(19)≈0.0037;P(20)≈0.0018.。。。 根據(jù)最低檢測濃度為10copies/反應(yīng),因此當(dāng)每2ul樣本溶液中小于等于9個時,即檢測不到。 P(≤9)=0.458,P(≥10)=0.542 20個平行全部為陽性的概率為P20=0.542∧20=4.786×e-6 19個平行全部為陽性的概率為P19=0.542∧19×0.458×20=8.089×e-5 18個平行全部為陽性的概率為P18=0.542∧18×0.458∧2×20×19÷2=6.493×e-4 因此P>17=0.000735≈0.735% 這樣的幾率幾乎不可能發(fā)生。 同時我計算了一下如果樣本濃度5coipes/ul,每反應(yīng)加入2ul,平行20次,17次以上陽性的概率達(dá)到95%以上得到的檢測試劑盒所需要的最低檢測濃度為4copies/反應(yīng),即2000coipes/ml.計算得到的P(≥4)=0.9818 以上是我的分析,其實我沒有多大把握,一旦我用錯模型就有可能出錯,但是我想以上結(jié)果一定出乎所有人的意料,也能解釋一些我們實驗中的問題,希望高人指點,讓這個問題不再是問題。 |
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