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huangchj03金蟲 (小有名氣)
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[交流]
關(guān)于分子診斷試劑盒常遇到的概率問題
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| 這個統(tǒng)計學(xué)問題是我自己想的，拿出來請教一下：假設(shè)一個分子檢測試劑盒的DNA最低檢測濃度為10copies/反應(yīng)，前提一，不考慮樣本提取過程中的富集作用；前提二，現(xiàn)提供驗證模板為200ul，濃度為5copies/ul，每反應(yīng)加樣2ul，問題是同時做20個平行實驗，17個以上為陽性的結(jié)果的概率是多少？為促進交流和學(xué)習(xí)，希望大家踴躍參與！我自己昨晚上也認真的分析了一下，稍后會將分析結(jié)果公布，我希望能在這個版塊將這個問題徹底解決了 |
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huangchj03(金幣+1): 謝謝參與
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， [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
5樓2015-01-24 11:31:18
huangchj03
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 1069.7
- 散金: 425
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- 帖子: 136
- 在線: 29.7小時
- 蟲號: 352572
- 注冊: 2007-04-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 發(fā)育生物學(xué)與生殖生物學(xué)
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昨晚我自己認真的計算了下，以下是我的計算過程： 第一：樣本滿足的是泊松分布，即描述在一定空間（長度、面積、體積）或一定時間間隔內(nèi)點子散布狀況的理想化模型，所以我認為樣本滿足泊松分布，而不是正態(tài)分布。 第二：解答過程。 先求出每2ul樣本中平均質(zhì)粒數(shù)或DNA數(shù)μ=10coipes； 再求出每2ul樣本中有x個DNA的概率，P（x）=10∧x/x!e∧10,帶入x=0、1、2、3。。。 。。。，即可得出相應(yīng)的概率P（0）、P（1）、P（2）。。。 P（0）≈0.0000454；P（1）≈0.000454；P（2）≈0.00227；P（3）≈0.00756；P（4）≈0.0189； P（5）≈0.0378；P（6）≈0.0631；P（7）≈0.0901；P（8）≈0.1126；P（9）≈0.1251；P（10）≈0.1251；P（11）≈0.1137；P（12）≈0.0948；P（13）≈0.0729；P（14）≈0.0521；P（15）≈0.0347；P（16）≈0.0217；P（17）≈0.0128；P（18）≈0.00709；P（19）≈0.0037；P（20）≈0.0018.。。。 根據(jù)最低檢測濃度為10copies/反應(yīng)，因此當(dāng)每2ul樣本溶液中小于等于9個時，即檢測不到。 P（≤9）=0.458，P（≥10）=0.542 20個平行全部為陽性的概率為P20=0.542∧20=4.786×e-6 19個平行全部為陽性的概率為P19=0.542∧19×0.458×20=8.089×e-5 18個平行全部為陽性的概率為P18=0.542∧18×0.458∧2×20×19÷2=6.493×e-4 因此P＞17=0.000735≈0.735% 這樣的幾率幾乎不可能發(fā)生。 同時我計算了一下如果樣本濃度5coipes/ul，每反應(yīng)加入2ul，平行20次，17次以上陽性的概率達到95%以上得到的檢測試劑盒所需要的最低檢測濃度為4copies/反應(yīng)，即2000coipes/ml.計算得到的P（≥4）=0.9818 以上是我的分析，其實我沒有多大把握，一旦我用錯模型就有可能出錯，但是我想以上結(jié)果一定出乎所有人的意料，也能解釋一些我們實驗中的問題，希望高人指點，讓這個問題不再是問題。 |
2樓2015-01-24 11:23:29
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huangchj03(金幣+1): 謝謝參與
huangchj03(金幣+1): 謝謝參與
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13樓2015-01-24 11:49:36
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