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16S rDNA常用引物序列
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16S rDNA常用引物序列 Normally, we used following primers to amplify bacterial 16S rRNA genes (27F and 1492R pair) and sequencing them (using other primers). The primer sequencs are all listed in the reference: Lane DJ (1991) 16S/23S rRNA sequencing. In: Stackebrandt E, Goodfellow M (eds) Nucleic acid techniques in bacterial systematics. Wiley, Chichester, pp 115-175 27F : 5’AGAGTTTGATCCTGGCTCAG 3' PCR and sequencing, most eubacteria CTGAGCCAGGATCAAACTCT 357F : 5’ CTC CTA CGG GAG GCA GCA G 3' Most eubacteria 530F : 5’ GTG CCA GCA GCC GCG G 3' Most eubacteria and archaebacteria 926F : 5’ AAA CTC AAA GGA ATT GAC GG 3' Most eubacteria and archaebacteria 1114F : 5’ GCA ACG AGC GCA ACC C 3' Most eubacteria 342R : 5’ CTG CTG C CT CCC GTA G 3' Most eubacteria 519R : 5’ GTA TTA CCG CGG CTG CTG 3' Most eubacteria anarchaebacteria 907R : 5’ CCG TCA ATT CCT TTG AGT TT 3' Most eubacteria and archaebacteria 1100R : 5’ GGG TTG CGC TCG TTG 3' Most eubacteria 1492R : 5’ TACGGCTACCTTGTTACGACTT 3' PCR and sequencing, most eubacteria AAGTCGTAACAAGGTAGCCGTA 1525R : 5’ AAG GAG GTG ATC CAG CC 3' PCR and sequencing, most eubacteria M=C:A, Y=C:T. K=G:T, R=A:G, S=G:C. W=A:T; all 1:1 |
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