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[求助]
測(cè)序小RNA文庫，鑒定植物病毒，用生物信息學(xué)如何分析 已有2人參與
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| 小弟我把有植物病毒的花葉做了小RNA文庫，公司沒有幫我分析，現(xiàn)在需要分析是哪種病毒，小弟我沒有接觸過生物信息學(xué)，所以請(qǐng)高手指點(diǎn)一下，如何鑒定這個(gè)病毒 |
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xingzhou823
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3樓2015-03-10 11:03:10
9樓2015-03-11 17:41:14
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具體原理我說不清，大致思路的話我個(gè)人理解是：把你的目的序列和搜集到的其他物種序列 比對(duì)后，用MEGA軟件，通過不同算法，計(jì)算物種之間的進(jìn)化距離，然后會(huì)有一個(gè)分類，計(jì)算時(shí)候會(huì)讓你選擇重復(fù)次數(shù)，可以選擇1000次，然后最后會(huì)得出一個(gè) bootstrap，簡(jiǎn)單解釋就是概率，就是把你這個(gè)目的蛋白和其他物種歸為一類的概率，或者說可信度。然后還會(huì)提供進(jìn)化距離，會(huì)顯示和其他物種親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近。我的表述或許不太準(zhǔn)確，大致這個(gè)理解。 |
10樓2015-03-11 17:50:54
xingzhou823
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