 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 884 | 回復(fù): 3 | |||
| 當(dāng)前主題已經(jīng)存檔。 | |||
[交流]
[求助]Linux下安裝Siesta的方法
|
|||
| 誰能詳細(xì)說一下Linux下安裝Siesta的具體步驟，包括編譯的過程。十分感謝！！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
2026年循環(huán)經(jīng)濟(jì)功能材料國(guó)際會(huì)議（ICFMCE 2026）
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
2026年第五屆電氣、電子與信息工程國(guó)際會(huì)議（ISEEIE 2026）
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
物理學(xué)I論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有78人回復(fù)
-
哈爾濱理工大學(xué)物理系招收物理學(xué)考研調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
0702一志愿吉大B區(qū)求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
0702一志愿吉大B區(qū)求調(diào)劑有論文
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
請(qǐng)問還有沒有用Latex寫文章的小伙伴們？
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
光學(xué)工程學(xué)碩調(diào)劑信息
已經(jīng)有28人回復(fù)
-
歡迎加入課題組
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
散金幣，求好運(yùn)，祝面上順利！
已經(jīng)有48人回復(fù)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
mengsk(金幣+10,VIP+0):非常感謝，希望能再詳細(xì)點(diǎn)！
lei0736(金幣+6,VIP+0):謝謝 夠詳細(xì)夠?qū)I(yè)
mengsk(金幣+10,VIP+0):非常感謝，希望能再詳細(xì)點(diǎn)！
lei0736(金幣+6,VIP+0):謝謝 夠詳細(xì)夠?qū)I(yè)
|
SIESTA-2.0安裝 0 推薦 SIESTA是采用數(shù)值原子軌道基矢展開晶體的波函數(shù)，離子實(shí)與價(jià)電子之間的相互作用采用模守恒贗勢(shì)來描述的，其突出之處實(shí)現(xiàn)了O(N)算法，可以用來進(jìn)行大規(guī)模數(shù)值計(jì)算，比如模擬蛋白質(zhì)分子等復(fù)雜結(jié)構(gòu)材料體系。目前已開發(fā)至2.0版本。要獲取該程序，先從http://www.uam.es/departamentos/ciencias/fismateriac/siesta/下載license文件，打印后填寫上你的個(gè)人信息，簽名后，把該license通過航空信郵寄至license上寫的地址，大概一周后，就會(huì)收到開發(fā)組告訴你下載SIESTA-2.0的帳號(hào)和密碼。 下載，解壓后，會(huì)有一下幾個(gè)目錄和文件： Docs/ Examples/ Pseudo/ README SIESTA_LICENCE Src/ Tests/ Tutorials/ Util/ version.info 進(jìn)入Src目錄，在它的子目錄Confs下，選擇合適的configure文件(以.conf結(jié)尾的)。它提供了針對(duì)pgf90, g95和ifc編譯的configure文件。這里以g95的為例： 將Confs子目錄下的g95-cdf.conf拷貝至Src目錄下arch.make 下面就可以鍵入make進(jìn)行編譯了。 (這里以假定安裝好了g95編譯器,以及把libnetcdf.a安裝到了/usr/local/netcdf-g95/lib/目錄中). 在Redhat上編譯Siesta 1.3的步驟 作者：elizerbeth 文章來源：Yepriyo@zixia 點(diǎn)擊數(shù)：524 更新時(shí)間：2005-12-8 平臺(tái)：Redhat Advanced Server 3.0 Intel Xeon 2 CPU 編譯器:pgi 5.1 Linux 86 具體步驟如下： 解壓 siesta1.3.tar.tgz 然后到Src/Sys目錄下，運(yùn)行cp pgf90.make ../arch.make 此時(shí)應(yīng)當(dāng)注意arch.make 理由這樣一句話： # Important (at least for V5.0-1 of the pgf90 compiler...) # Compile atom.f without optimization. 我的理解是對(duì)pgf90 v5.01 編譯atom.f應(yīng)without optimization, 在此編譯器為V5.1 ,因此，將 # atom.o: $(FC) -c $(FFLAGS_DEBUG) atom.f 改為 # atom.o: $(FC) -c $(FFLAGS) atom.f 按照pgf90地說明FFLAGS是對(duì)應(yīng)的with optomization, 保存arch.make退出，然后運(yùn)行 make 即編譯siesta不報(bào)錯(cuò)。 此行語句如果不修改的話，編譯仍將報(bào)錯(cuò)。 接著在Pseudo/atom 目錄下運(yùn)行make編譯Pseudo。 為了驗(yàn)證siesta編譯成功，按照manual在siesta/test下建立test.fdf atom.psf 文件，其中atom.psf是要考察原子的Pseudo文件， 運(yùn)行 ../siesta < test.fdf |tee test.out,如果siesta成功編譯的話，即會(huì)輸出相應(yīng)的計(jì)算可結(jié)果。 |
2樓2008-06-19 14:13:31
★ ★
lei0736(金幣+2,VIP+0):謝謝持續(xù)關(guān)注 十大“耐思”版主評(píng)選歡迎參與投票 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
lei0736(金幣+2,VIP+0):謝謝持續(xù)關(guān)注 十大“耐思”版主評(píng)選歡迎參與投票 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
|
我上次是用gfortran編譯的并行版，現(xiàn)在好久沒用，也記不是很清楚了。 按照版主的要求“再詳細(xì)點(diǎn)”，我今天再次重新編譯了一次，實(shí)際上siesta很容易編譯，如果你安裝有一個(gè)默認(rèn)的fortran90編譯器的，比如intel fortran編譯器（ifort），你只要直接下載siesta2.0.1.tar.tgz后，放到你的目錄，用tar -zxvf siesta2.0.1.tar.tgz解壓，然后進(jìn)入siesta-2.0.1/Src目錄下，./configure后直接make就可以了。 并行版稍微復(fù)雜一點(diǎn)點(diǎn)。 |
3樓2008-06-21 17:01:27
4樓2008-06-23 11:10:27
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 mengsk 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 085600材料與化工調(diào)劑 324分 +4 | llllkkkhh 2026-03-18 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0817 化學(xué)工程 299分求調(diào)劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章 +7 | rare12345 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 334求調(diào)劑 +3 | 志存高遠(yuǎn)意在機(jī)?/a> 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 考研求調(diào)劑 +3 | 橘頌. 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +4 | 太陽花天天開心 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 淇ya_~ 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | ahbd 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 機(jī)械專碩調(diào)劑
+3
|
笨笨兔子 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 中科大材料專碩319求調(diào)劑 +3 | 孟鑫材料 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)] 現(xiàn)在如何回避去年的某一個(gè)專家，不知道名字 +3 | zk200107 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 復(fù)試調(diào)劑 +3 | 呼呼？~+123456 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工求調(diào)劑一志愿 985 總分 295 +8 | dream…… 2026-03-12 | 8/400 |
|
|
|
[考研] ［0860］321分求調(diào)劑，ab區(qū)皆可 +4 | 寶貴熱 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +3 | miaodesi 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求b區(qū)學(xué)校調(diào)劑 +3 | 周56 2026-03-11 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +3 | S.H1 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 土木第一志愿276求調(diào)劑，科研和技能十分豐富，求新興方向的導(dǎo)師收留 +3 | 土木小天才 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +3 | 是Lupa啊 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +3 | 李政瑩 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | ADT 2026-03-13 | 3/150 |
|