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moye1991新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
急求助��！amber和WHAM的問(wèn)題，自由能曲面 已有1人參與
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求助各位仁兄！ 我用amber進(jìn)行了REMD的模擬，一個(gè)蛋白質(zhì)，26個(gè)溫度副本。現(xiàn)在想得到自由能曲面，用WHAM的方法，Grossfield Lab的。那么這個(gè)網(wǎng)站提供的這個(gè)程序怎么安裝在我的電腦上呢？有沒(méi)有同學(xué)裝過(guò)？它的說(shuō)明書(shū)安裝好簡(jiǎn)單，我照做了還是鍵入wham-2D命令沒(méi)有辦法啟動(dòng)。我想得到三維的自由能曲面，兩個(gè)坐標(biāo)分別為Rg，RMSD。那么WHAM中的metadatafile的輸入文件我要怎么寫(xiě)，怎么處理得到的amber的輸出文件才能實(shí)現(xiàn)這個(gè)目的？有哪位高手做過(guò)的嗎？跪求指導(dǎo)！謝謝！ |
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蘭S水晶
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2樓2020-11-17 10:32:38
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