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建立QSAR的Descriptors應(yīng)該如何選擇？ 已有3人參與
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| 如題，另外，QSAR的建立方法應(yīng)該怎么選？Descriptors和Model是各種都試一下，看用哪種方法建立的結(jié)果比較好？還是根據(jù)自己的分子情況選的，如果這樣，應(yīng)該怎么選擇？ |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhad33: 金幣+10, ★★★很有幫助 2015-04-28 14:38:15
zhad33: 金幣+10, ★★★很有幫助 2015-04-28 14:38:15
| 建立QSAR的方法很多，如SVM、KNN、RF、DT和NB等等，如果是以QSAR為主題發(fā)表論文，我建議每個流行的方法都應(yīng)當(dāng)嘗試，單個方法想發(fā)一篇好文章很困難。至于描述子選擇，可以先刪除都是常量的描述子，如都為1，0等；再次考察變量間的相關(guān)性，依據(jù)相關(guān)系數(shù)刪除相關(guān)性高的變量；也可通過建立回歸方程，考察目標(biāo)變量與自變量間的相關(guān)性，選擇保留相關(guān)性高的變量即可。變量選擇方法很多，QSAR文章應(yīng)該都有提到。我個人認為QSAR應(yīng)該首選線性算法，這樣易于模型解釋；在對結(jié)果影響不大的模型基礎(chǔ)上，減少描述子，越少越好，易于機理的解釋。 |
3樓2015-04-01 10:26:59
cych0815
金蟲 (小有名氣)
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- 金幣: 2142.8
- 帖子: 155
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- 注冊: 2014-10-18
- 專業(yè): 藥物設(shè)計與藥物信息
2樓2015-03-27 08:51:32
4樓2015-04-01 17:10:25
5樓2016-06-03 21:27:58
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