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建立QSAR的Descriptors應該如何選擇? 已有3人參與
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| 如題,另外,QSAR的建立方法應該怎么選?Descriptors和Model是各種都試一下,看用哪種方法建立的結果比較好?還是根據(jù)自己的分子情況選的,如果這樣,應該怎么選擇? |


金蟲 (小有名氣)
| 建立QSAR的方法很多,如SVM、KNN、RF、DT和NB等等,如果是以QSAR為主題發(fā)表論文,我建議每個流行的方法都應當嘗試,單個方法想發(fā)一篇好文章很困難。至于描述子選擇,可以先刪除都是常量的描述子,如都為1,0等;再次考察變量間的相關性,依據(jù)相關系數(shù)刪除相關性高的變量;也可通過建立回歸方程,考察目標變量與自變量間的相關性,選擇保留相關性高的變量即可。變量選擇方法很多,QSAR文章應該都有提到。我個人認為QSAR應該首選線性算法,這樣易于模型解釋;在對結果影響不大的模型基礎上,減少描述子,越少越好,易于機理的解釋。 |

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