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表型組相關
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隨著二代測序技術的發(fā)展,在育種群體中獲取標記數(shù)據(jù)的成本在不斷降低,這有利于研究人員更好的定位與某些表型相關的數(shù)量性狀位點,然而,對相關表型的QTL進行準確的定位需要高質(zhì)量的表型數(shù)據(jù)。 第一本書主要講述了如何獲取表型組學數(shù)據(jù)。 1.Phenomics How Next-Generation Phenotyping is Revolutionizing Plant Breeding。 第二本書主要講述了利用R軟件對形態(tài)進行分析,這可以適用于葉形態(tài),魚形態(tài)的分析,利用獲得的形態(tài)數(shù)據(jù)可以完成數(shù)量性狀位點的定位。 2.Morphometrics with R。 如果大家對形態(tài)的數(shù)量性狀位點定位感興趣可以聯(lián)系我。 |
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你好,我簡單談以下我所接觸的實驗,不過不是大田實驗都是室內(nèi)實驗。1. 某植物幼苗根生長形態(tài)測定,這里我們利用成像系統(tǒng) 獲得了一個群體根在不同時間段的2D或者3D 形態(tài),利用形態(tài)分析技術對這些圖像處理,獲得一些關鍵數(shù)據(jù)(作為表型)能夠刻畫根的形態(tài)。2. 使用表型組學平臺,對某一雜交群體的不同生長階段43個表型進行了測定。對于大田實驗,我不清楚,不過書中第六章有介紹,不過我聽過有人用核磁共振對大田玉米的根結(jié)構(gòu)進行掃描。 我覺得對一些表型可以直接進行測量,可能誤差也不太大,但一些表型例如葉形態(tài),根形態(tài)等 利用圖像處理技術可以更準確的量化。在就是目前的表型組平臺,但不適合大田。 |
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